林剑邦 发表于 2016-12-30 14:07:04

测序结果核糖体污染！

最近开展外泌体miRNA的研究，提取RNA后检测，结果显示样品核糖体污染，不知大家出现过这种情况吗？是细胞污染的原因吗，要如何避免呢？虚心向大家请教~谢谢！
我猜想是我没有进行过滤处理，有可能是这个原因吗？

baishixiaoyaozi 发表于 2016-12-31 02:50:39

hzangs 发表于 2016-12-30 14:57
根据一些做测序朋友的反馈。外泌体测序的时候确实会测到大约20%的数据是核糖体序列、 ...

我们实验室做过蛋白组分析，exosomes携带核糖体

hzangs 发表于 2016-12-30 14:57:32

根据一些做测序朋友的反馈。外泌体测序的时候确实会测到大约20%的数据是核糖体序列、

hzangs 发表于 2016-12-31 11:48:58

baishixiaoyaozi 发表于 2016-12-31 02:50
我们实验室做过蛋白组分析，exosomes携带核糖体

嗯嗯，这个确实有paper报道的数据也显示 测序结果中有核糖体序列

微泡biomarker 发表于 2017-1-3 21:34:35

baishixiaoyaozi 发表于 2016-12-31 02:50
我们实验室做过蛋白组分析，exosomes携带核糖体

您好，请教一下大神怎么在外泌体的蛋白组学分析里面，分析出携带核糖体信息？

baishixiaoyaozi 发表于 2017-1-3 23:19:34

微泡biomarker 发表于 2017-1-3 21:34
您好，请教一下大神怎么在外泌体的蛋白组学分析里面，分析出携带核糖体信息？ ...

质谱分析检测到多个核糖体亚基蛋白，后续western blot进一步验证

Marvel 发表于 2017-1-4 11:48:36

外泌体不是本身就是从核糖体源头分泌而来的吗，肯定是很多成分是核糖体吧
页: [1]
查看完整版本: 测序结果核糖体污染！