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标题: 做外泌体RNA的注意了!即使去除外泌体的血清也可能干扰... [打印本页]

作者: 土豆    时间: 2016-8-17 16:28
标题: 做外泌体RNA的注意了!即使去除外泌体的血清也可能干扰...
做外泌体RNA的注意了!

即使去除外泌体的血清也可能干扰你细胞外泌体的RNA组成!!

胎牛血清(FBS)已在真核细胞培养中使用了几十年了。然而,很少有人关注FBS的RNA对培养的细胞会产生什么样的生物学效应。来自哈佛医学院的研究人员用RNA测序,证明了FBS含有蛋白质编码和调控的多种RNA,包括mRNA、miRNA、rRNA和snoRNA等。它们中的大多数(>70%)仍然存在于细胞外囊泡(EV)和细胞间通讯研究中常使用的长时间超速离心得到的无囊泡FBS(vesicle-depleted FBS, vdFBS)中。FBS相关的RNA会在分离细胞外膜泡RNA(exRNA)时一同被分离出来,这会对下游RNA分析造成干扰。许多进化上保守的FBS源的RNA种类会被错误地认为是人或小鼠细胞的转录本。值得注意的是,在FBS中含量丰富的一些miRNAs,如miR-122、miR-451A和miR-1246,先前已被报道为在培养细胞来源的细胞外膜泡中富含的miRNAs,这可能是胎牛血清中miRNAs造成的假象。对公开可用的exRNA数据库的分析支持FBS污染的概念。此外,FBS转录本可被培养的细胞吸收,并影响高度敏感的基因表达谱技术的结果。因此,实验设计过程中采取减少FBS源RNA干扰的预防措施是非常有必要的。
参考文献:
Wei, Z., et al. (2016). "Fetal Bovine Serum RNA Interferes with the Cell Culture derived Extracellular RNA." Sci Rep 6: 31175.
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作者: wxz    时间: 2016-8-17 17:02
我就是做Exosomes RNA的,看到这个好激动
作者: 正经的保洁小弟    时间: 2016-8-17 17:02
辛苦了,真的辛苦了,大有收获
作者: Lightguider    时间: 2016-8-17 22:42
换言之,这个mRNA 会不会对细胞的外泌体分泌产生影响?
作者: 冷雪儿翱翔    时间: 2016-8-18 10:46
来学习~~
作者: 土豆    时间: 2016-8-18 10:57
Lightguider 发表于 2016-8-17 22:42
换言之,这个mRNA 会不会对细胞的外泌体分泌产生影响?

有这个可能性~
作者: kasangzc    时间: 2016-8-18 11:00
感谢分享 学习一下
作者: hereissyk    时间: 2016-8-18 14:19
我做过肠癌细胞exosomes RNA测序,1246含量的确很高。
作者: seallin    时间: 2016-8-18 15:05
还是做蛋白的好,没有这个担心,只要我把细胞用SILAC一标,有标记的必定是来自于细胞的~~~
作者: xhn890    时间: 2016-8-18 17:08
多谢。辛苦了,真的辛苦了
作者: xiongbo2010    时间: 2016-8-19 20:05
谢谢!涨知识了
作者: wenhao222_lh    时间: 2016-8-19 21:11
恩哼,血清替代物的春天来了?
作者: bingwendao    时间: 2016-8-23 10:44
学习了,谢谢楼主分享
作者: huangkai0805    时间: 2016-9-7 15:19
做外泌体这块研究,如何去除外泌体的影响啊
作者: gaocunyi    时间: 2016-9-12 17:09
非常感谢楼主的提醒
作者: 枫林摇曳    时间: 2016-9-13 10:16
减少FBS源RNA干扰的预防措施都有哪些呢?
作者: dlwlrma    时间: 2016-9-18 10:21
外泌体microRNA功能的研究要考虑好多问题啊
作者: yangzijiang    时间: 2016-9-18 11:34
111111111111111111111
作者: 扫尽尘嚣    时间: 2016-9-30 12:45
受教,这种情况该怎么设置对照啊
作者: 叶香辰    时间: 2016-9-30 14:38
谢谢分享!
作者: ron1987    时间: 2016-10-11 10:39
ddddddddddddddddddd
作者: baixjtu    时间: 2016-10-16 22:15
那如何尽量避免FBS中RNA对下游试验的干扰呢?有一种数据做出来的都不敢相信的赶脚
作者: Joyel    时间: 2016-10-25 16:42
谢谢11111111111111111
作者: exosun    时间: 2016-10-30 00:35
我也是刚开始,O(∩_∩)O谢谢
作者: konggy    时间: 2016-11-14 15:43
感谢楼主,学习了
作者: dancing    时间: 2016-11-23 14:37
那如何避免呢,饥饿处理吗
作者: xiaodoudou    时间: 2016-11-23 19:18

作者: xiaodoudou    时间: 2016-11-23 19:21
hereissyk 发表于 2016-8-18 14:19
我做过肠癌细胞exosomes RNA测序,1246含量的确很高。

一般用多大体积及量的外泌体提取RNA呢?我用的也是肠癌细胞。谢谢了
作者: rocketlow    时间: 2016-11-30 23:13

多谢。辛苦了,真的辛苦了
作者: AIR2000    时间: 2016-12-19 10:38
谢谢分享
作者: 孙大大    时间: 2017-1-4 15:40
好激动,怎样去避免这种情况了,做RNA的岂不是又要排除这个因素
作者: anan68    时间: 2017-2-18 14:49
谢谢谢谢。
作者: ccx5201314    时间: 2017-2-22 10:08
学习了,谢谢
作者: meiling    时间: 2017-2-22 16:25
wxz 发表于 2016-8-17 17:02
我就是做Exosomes RNA的,看到这个好激动

请问你做RNA什么呀?检测吗?我也是 ,希望以后多多交流
作者: wxz    时间: 2017-2-24 16:25
meiling 发表于 2017-2-22 16:25
请问你做RNA什么呀?检测吗?我也是 ,希望以后多多交流


作者: yuppy    时间: 2017-3-4 15:13
学习学习
作者: Pulisic    时间: 2017-3-9 20:12
谢谢分享
作者: zhengdongying    时间: 2017-3-14 15:05
辛苦楼主
作者: droyx24    时间: 2017-3-24 15:15
准备做miRNA,看到这个感觉不知道要不要继续做啊
作者: lulu    时间: 2017-3-28 21:16
顶起,先谢谢版主的分享
作者: 简草苍苍    时间: 2017-3-28 22:18
学习了,值得注意
作者: Maxueqing    时间: 2017-3-29 08:48
谢谢分享,共同进步
作者: zestyhuan    时间: 2017-3-29 12:54
收藏,好资源
作者: 2513678920    时间: 2017-4-26 23:35
haofenxiang
作者: xcf201314    时间: 2017-4-28 15:34
感谢分享
作者: Exosomeslover    时间: 2017-5-4 10:13
哈哈哈哈

作者: wcxbf2014    时间: 2017-5-11 17:05
那么实验该怎么进行呢

作者: 北燕南飞    时间: 2017-5-23 15:17
谢谢分享
作者: zlpxiangya    时间: 2017-5-25 09:57
正在做,学习学习!
作者: cj18w    时间: 2017-5-28 13:01
66666666666666666666666
作者: veravvl    时间: 2017-6-3 14:49
学习了,谢谢版主。。很想问,那不能用去外泌体FBS培养的细胞分泌的外泌体来研究RNA的话,那研究外泌体RNA有什么比较好的方法吗?
作者: 小小菜鸟    时间: 2017-6-15 13:23
111111111111
作者: chenxiaolin1985    时间: 2017-6-20 14:48
可以看看,试试dDDD
作者: husthuagai    时间: 2017-6-29 00:45
这个学习了!!
作者: petpan0107    时间: 2017-8-30 11:32
学习了,但如何去除血清中RNA的干扰呢?
作者: Kmapauc    时间: 2017-9-5 17:16
感谢楼主
作者: 澪九    时间: 2017-9-12 00:03
谢谢楼主
作者: 红枫飞雪633    时间: 2017-9-12 09:44
感谢楼主,又学到很多。
作者: xiaodouding    时间: 2017-9-16 16:36
感谢分享
作者: zyb-1023    时间: 2017-9-20 09:38
我正在做外泌体RNA的
作者: Miss神佑    时间: 2017-9-20 16:43
哦,还有这种操作
作者: 上善若水    时间: 2017-9-23 16:25
不知道有没有提解决办法
作者: Lillian    时间: 2017-9-25 19:26
赞一个"Fetal Bovine Serum RNA Interferes with the Cell Culture derived Extracellular RNA"
作者: rjshimm    时间: 2017-9-26 08:53
谢谢楼主,楼主好人!
作者: PUAPUA    时间: 2017-10-25 19:33
谢谢,辛苦了
作者: midy0714    时间: 2017-11-2 10:30
谢谢分享
作者: 墨清    时间: 2017-11-8 10:07
感谢楼主分享
作者: cjs2004    时间: 2017-11-14 14:18

来学习~~
作者: zxlyy    时间: 2017-11-29 19:13
谢谢分享
作者: oekm    时间: 2017-11-30 22:27
谢谢楼主分享
作者: allkyu    时间: 2017-12-5 16:51
学习学习学习学习学习学习
作者: Eric91    时间: 2017-12-9 13:11
很有意义的一项研究,多谢分享
作者: haks    时间: 2017-12-9 15:27
谢谢分享,学习了。
作者: waimiti    时间: 2017-12-22 20:35
好棒啊,新手上路,学习中

作者: sesame0415    时间: 2018-1-10 10:43
大有收获
作者: wql84713601    时间: 2018-2-27 20:56
谢谢分享
作者: wjy    时间: 2018-2-28 10:30
谢谢分享
作者: 外泌小白    时间: 2018-2-28 15:27
谢谢分享
作者: xxd18826401689    时间: 2018-2-28 20:43
原来是这样!学习了!
作者: DAN调    时间: 2018-3-12 17:07
谢谢版主的分享

作者: liufenguro    时间: 2018-3-18 09:48
!!!!!!!!!!!!!!!!!!
作者: chenjinxia    时间: 2018-3-21 10:07
谢谢分享
作者: 胡杨    时间: 2018-4-8 23:26
谢谢分享
作者: 伊森007    时间: 2018-4-9 09:56
感谢分享
作者: dalianyikedaxue    时间: 2018-4-16 13:46
激动地学习一下

作者: google23    时间: 2018-4-26 11:12
好东西,谢谢分享
作者: baiyu    时间: 2018-5-18 02:42
谢谢分享
作者: eastpoison    时间: 2018-5-24 16:43
学习一下
作者: kerstin_yang    时间: 2018-5-28 10:27
辛苦了,学写一下!
作者: 奥比克    时间: 2018-6-2 17:05
感谢楼主分享
作者: 奥比克    时间: 2018-6-2 17:07
wxz 发表于 2016-8-17 17:02
我就是做Exosomes RNA的,看到这个好激动

请问是怎么提取exosomes的总RNA的,我用常规的方法总是提不出,跑胶没条带。。。。
作者: lancyca    时间: 2018-6-21 11:27
谢谢分享
作者: 只会翻身的咸鱼    时间: 2018-6-24 13:51
感谢楼主分享
作者: www2532106    时间: 2018-6-25 09:39
赞赞赞vvvvvvvvvv
作者: stark    时间: 2018-6-25 10:21
感谢分享!!!
作者: pengPENG1234    时间: 2018-7-25 12:25
谢谢分享
作者: pengPENG1234    时间: 2018-7-25 12:29
谢谢分享
作者: explore    时间: 2018-8-15 11:38
涨知识了,多谢
作者: 馒头周    时间: 2018-11-23 16:16
着实有用
作者: 玉米汁    时间: 2018-11-30 09:17
感谢分享




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