外泌体之家 | 细胞外膜泡领域核心平台—exosomes & microvesicles—小膜泡大作用
标题: 【2017.07.09】This Week in Extracellular Vesicles [打印本页]
作者: hzangs 时间: 2017-7-9 14:47
标题: 【2017.07.09】This Week in Extracellular Vesicles
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本周hzangs在最新文献中选取了11篇分享给大家，其中9篇提供中文摘要。涉及内容十分广泛，其中第1篇介绍了细胞外囊泡作为独立代谢单元发挥功能，这一报道必将引领一个新的小方向的诞生，在过去大家只关注了囊泡运送货物，但是货物在被运送过程中是否会发挥功能呢，这篇文章给得出了答案，同时暗示着囊泡可能独立改变微环境，重点推荐大家关注和学习一下这篇文章；第1篇介绍了MLKL如何在细胞外囊泡蛋白分选过程中被分选进入囊泡，IF很高的文章哦；另外文末附上了Methods Mol Biol最新发表的一些技术试验protocol，相信很多朋友用得上，不要错过哦。相关文章的原文都在论坛同名贴下，需要的可以到论坛下载。
1. Extracellular vesicles are independentmetabolic units with asparaginase activity.细胞外囊泡是一个独立的代谢单元，能够发挥天冬酰胺酶活性。 [Nat Chem Biol] IF=12.71 PMID：28671681
摘要：细胞外囊泡（EVs）是涉及细胞与微环境之间和更广泛范围内的生物活性分子交换的具膜纳米颗粒。 尽管已经有研究表明细胞可以通过EV传播代谢酶，但是关于它们的内EVs中的代谢活性仍然有待阐明。 因此，本文中我们评估了神经干/祖细胞（NSC）来源的EVs消耗和产生代谢物的能力。 我们的代谢组学和功能分析显示，EVs具有L-内酰胺酶活性，这一活性是通过携带的天冬酰胺酶样蛋白1（Asrgl1）实现的。 最重要的是，我们的数据显示Asrgl1活性对天冬酰胺具有酶活性，而对谷氨酰胺没有酶活性。 我们发现鼠和人类NSC产生的EVs均会运输Asrgl1。 我们的研究结果首次表明，NSC EVs能够作为独立的代谢单位，能够修改微环境中关键营养物质的浓度，并有可能影响其微环境的生理学。
PS：囊泡作为生物活性成分的运输者，大量的paper报道集中在囊泡传递信号分子方面，而本文则重点介绍了囊泡作为一个独立的代谢单位发挥代谢作用。这可能是之前的研究忽视的一点，大量的酶类可能会被释放到细胞外发挥功能，相信这方面会有更多的报道，我们拭目以待。
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2. MLKL, the Protein that MediatesNecroptosis, Also Regulates Endosomal Trafficking and Extracellular VesicleGeneration.。 [Immunity] IF=24.08 PMID：28666573
摘要：假蛋白酶混合谱系激酶结构域（MLKL）在蛋白激酶RIPK3磷酸化后的激活会触发坏死性凋亡，这是一种程序性细胞死亡形式，其中细胞膜破裂造成细胞内成分的释放。我们研究发现MLKL还与内体相关并控制内吞蛋白的转运，从而增强受体和配体的降解，调节其诱导的信号并促进细胞外囊泡的产生。这种作用存在两个不同的状态：独立于RIPK3的组成型和由RIPK3触发的增强的，后一种状态下MLKL与内体的关联回增强，MLKL会结合运输所需的内体分选复合物（ESCRT ），并与它们一起进入囊泡，脱离细胞。我们认为磷酸化MLKL在细胞外囊泡中的释放是作为细胞自身限制这种蛋白质诱导坏死活性的机制。
PS：这是一篇涉及到细胞外囊泡分选机制的文章，文章报道了MLKL可以被内体分选蛋白复合体结合进入囊泡中，脱离细胞。很不错的一篇文章，值得大家读一读。
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3. The potential of enduranceexercise-derived exosomes to treat metabolic diseases.耐力运动诱导产生的外泌体具有治疗代谢疾病的潜力。 [Nat Rev Endocrinol] IF=15.43 PMID：27230949
摘要：已知耐力运动介导的多系统适应性可减轻代谢相关疾病，如肥胖和2型糖尿病（T2DM）。然而，耐力运动促进器官之间交叉通讯和整塑代谢作用的潜在分子机制仍不清楚。运动诱导骨骼肌和其他器官（统称为“exerkine”）释放的肽和核酸涉及这些系统反应。两种细胞外囊泡，外泌体和微囊泡已被证明含有参与各种生理和病理过程的蛋白质和核酸。具体来说，外泌体已经表现出能够促进细胞和组织之间的肽，微RNA，mRNA和线粒体DNA的交换。有趣的是，细胞外囊泡响应耐力运动，循环细胞外囊泡含量以强度依赖性方式增加。我们认为运动对全身的益处是由外泌体和/或微泡以自分泌，旁分泌和/或内分泌的方式起作用的。此外，我们认为exerkine来源的天然或修饰的外泌体和/或微囊泡将在治疗肥胖和T2DM方面具有治疗效用。
PS：之前向大家介绍过运动会带来血浆外泌体含量的提升，这篇综述则汇总了运动诱导囊泡增加，同时这些囊泡对身体产生益处的报道，同时认为这些囊泡可能在代谢类疾病的治疗中发挥功能。
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4. Rapid Isolation and Detection ofExosomes and Associated Biomarkers from Plasma.快速分离检测血浆中外泌体用于生物标志物检测。 [ACS Nano] IF=13.33 PMID：28671449
摘要：在循环中的外泌体是重要的癌症相关RNA和蛋白质生物标志物的重要来源，它被给予希望用于早期检测，液体活检和及时护理诊断应用。然而，由于其体积小（50-150nm）和密度低，所以从血浆中分离外泌体比较困难。目前常用的分离方法耗时耗力，不太可能转化为诊断应用程序。为了解决这个问题，我们开发了交流电动（ACE）微阵列芯片装置用来从未稀释的人血浆样品中快速分离和纯化成胶质细胞瘤外泌体。 ACE装置指需要较少的血浆样品（30-50μL），能够在15分钟内将外泌体集中到ACE微电极周围的高场区域，简单的缓冲洗涤可以去除大量的血液成分，使外泌体浓缩在微电极上。整个分离过程和芯片上的荧光分析在不到30分钟内即可完成，随后可以在芯片上进行外泌体蛋白免疫荧光检测，并为RT-PCR分析提供可靠的mRNA。这些结果证明了ACE设备能够简化外泌体分离和纯化过程，显着减少了处理步骤和所需的时间。
PS：利用类似电泳的方法富集外泌体，值得关注和学习一下哦，微流控芯片一直是外泌体纯化方法中最有希望进入临床检测的系统，从事检验工作的朋友可以关注一下这篇文章。
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5. Field-Free Isolation of Exosomes fromExtracellular Vesicles by Microfluidic Viscoelastic Flows.利用微流体粘弹性流动建立电场磁场非依赖性的方法从细胞外囊泡中纯化外泌体。 [ACS Nano] IF=13.33 PMID：28679045 摘要：几乎所有哺乳动物细胞都会分泌的外泌体，它可以携带活性分子，被认为是鉴定许多包括癌症在内的疾病潜在生物标志物。 然而，由于外泌体的体积很小（30-200nm），因此分离含有不同大小的各种细胞外泡（EV）的复合培养基时尤其是在小样本体积中存在巨大的挑战。 在这里，我们提出一种基于粘弹性的微流体系统，以连续，大小依赖和无标记的方式从细胞培养基或血清直接分离外泌体。 使用少量生物相容性聚合物作为介质中的添加剂来控制施加在EV上的粘弹性，我们能够实现外泌体的高纯度（> 90％）和回收率（> 80％）的分离。本文所提出的技术可以作为多功能平台，以促进不同生化应用中的外泌体分析。
PS：给予微流控芯片的有一种外泌体分离方法。
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6. Extracellular Vesicle Biology in thePathogenesis of Lung Disease.细胞外囊泡生物学与肺疾病病理。 [Am J Respir Crit Care Med] IF=13.20 PMID：28678586
摘要：随着我们对肺部疾病的了解不断深入，我们认识到促进细胞/环境通信导致疾病发展的机制是十分复杂的。 2008年，研究人员首先发现了循环系统中完整的无细胞微小RNA中的一部分是位于被称为细胞外囊泡（EVs）的脂质包封的微泡内。在这一发现前后，研究人员确定了EVs可能会促进人类疾病和调整机体动态平衡。EVs的膜结构能够保护包括蛋白质，miRNA和mRNA在内的内容物免于降解，E这些内容物可以反映疾病发生的发病机制，并且可以在细胞之间发挥通信作用，改变受体细胞的功能。此外，已经有报道在包括血，尿，痰和支气管肺泡灌洗液等体液中检测到EV。肺部在环境刺激和疾病发生发展过程中细胞释放EV在疾病中增加了细胞间通讯的复杂性。虽然大多数涉及EVs的人类生物学研究实在癌症中进行，但是我们已经看到在其他病理生理条件下基于EV的研究报道。 EV介导的遗传物质在肺内细胞间传播促进疾病发展将环境应激因子与肺免疫反应联系起来。
PS：这是一篇综述文章，主要介绍了细胞外囊泡与肺部疾病之间的关系。
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7. Pathogenesis of pancreatic cancerexosome-induced lipolysis in adipose tissue.胰腺癌细胞来源的外泌体诱导脂肪组织的脂肪分解的病理机制。 [Gut] IF= 14.92 PMID：26061593 摘要：在胰腺癌（PC）出现临床表现前几个月发生的新发糖尿病和伴随的体重减轻似乎是肿瘤分泌产物引起的伴随作用。我们最近的研究结果表明，外泌体携带的肾上腺髓质素（AM）在PC的糖尿病发展中发挥着重要作用。脂肪组织的脂肪分解可能解释PC早期发病过程中的体重下降。我们假设诱导脂肪分解的信号是由PC释放的外泌体携带而来的，并且引起相应伴随作用。因此，在这项研究中，我们研究了PC分泌的外泌体是否能够在脂肪细胞中诱导脂肪分解，并探讨AM在PC外泌体中作为这种脂肪分解的介质的作用。我们分离和表征了患者来源的细胞系释放的外泌体和患有PC与非PC对照的患者血浆来源外泌体。将分化的鼠（3T3-L1）和人类脂肪细胞暴露于这些外泌体之下，使用甘油测定和蛋白质印迹来检测脂肪的分解。 Duolink测定用于研究用外泌体处理的脂肪细胞中的AM与肾上腺髓质素受体（ADMR）相互作用。在鼠和人体脂肪细胞中，我们发现AM和PC-外泌体都会促进脂肪分解。这一过程可以被ADMR阻断。 AM与脂肪细胞上的受体相互作用，活化p38和ERK1 / 2，并通过磷酸化激素敏感性脂肪酶促进脂肪分解。 PKH67-标记的PC-外泌体很容易内化到脂肪细胞，并涉及caveolin 和巨胞饮作用增强。PC分泌的外泌体在皮下脂肪组织中诱导脂解; 外泌体中的 AM是这种效应的信号传递分子。
PS：胰腺癌外泌体携带的分子调控脂肪细胞中脂肪的降解，从而解释了胰腺癌发病前期出现的体重下降现象。
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8. Remote control of BBB: A tale ofexosomes and microRNA.对血脑屏障的远程控制：外泌体与microRNA的故事。 [Cell Res] IF=14.81 PMID：28674430
摘要：外泌体介导的细胞间通讯已成为人类健康和疾病的新兴研究领域。 Cell Research最近发表的一项研究报告指出，斑马鱼神经元可通过分泌外泌体携带miR-132来远程调节血脑屏障完整性。
PS：这是一篇评论性文章。主要针对的是前段时间由中科院上海生科院神经所的老师发表在cell research上的一篇关于斑马鱼神经元细胞释放外泌体携带miR-132调控血脑屏障完整性的报道。该文章的思路很清晰，研究的内容也相对比较完整和透彻，值得大家学习和借鉴。
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9. Extracellular vesicles ingastrointestinal cancer in conjunction with microbiota: On the border ofKingdoms.肠胃肿瘤中细胞外囊泡与微生物共同作用：在身体王国与微生物王国边界上的故事。 [Biochim Biophys Acta] IF=5.37 PMID：28669749
摘要：后生动物细胞产生细胞外泡（EV）是以及原核生物产生菌体外膜泡是生物的普遍特征。这些膜泡结构具有携带蛋白质的磷脂膜，包裹着DNA和不同类型的RNA，并作为信息快递大量参与对靶细胞的细胞间通信。在过去十年中，由于研究技术方法的发展，研究者对EV的兴趣愈发浓厚，对其在各种病理学中的作用进行了广泛的研究。本研究的重点是结合GI微生物群和炎性疾病评估EV对胃肠道（GI）癌症的作用。我们还讨论了近期关于EVs及其内容作为胃癌早期诊断生物标志物的前景。菌体外膜泡也涉及GI慢性炎性疾病的发病机制，然而，菌体外膜泡在肿瘤发生中的可能作用仍然被低估。我们认为来自真核细胞以及来自不同微生物，真菌，寄生物种和胃肠道中被食用植物的EV都可以作为细胞内和物种间通讯的介质，这些通讯过程特别促进了肿瘤细胞存活和多药物耐受。总之，我们认为通过EV蛋白质组（可从公共数据库获得）与已知的微生物肠道细菌蛋白质序列比对分析可用于鉴定进化保守蛋白序列之间抗原模拟。使用这种方法我们确定了拟杆菌属（Bacteroides spp）具有激活环的假性激酶与PDGFRα的同源性，提供了概念验证。我们推测，“模拟”PDGFRα的微生物假性激酶的存在可能与真正的PDGFRα有关系，其在结直肠癌发生中作用有待进一步研究。
PS：文章的内容可能不是很严谨，获得的结果可能不是十分可靠，但是文章的思路值得我们学习和思考。文章作者重点研究了胃肠系统囊泡携带的蛋白质与细菌携带的蛋白质的同源性，将其中相似度高的同源蛋白进行分析，并提出合理猜测认为这些相似的同源蛋白在胃肠癌症的发展中可能存在功能和作用。
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10. Neutrophil-Derived Exosomes: A NewMechanism Contributing to Airway Smooth Muscle Remodeling.中性粒细胞来源的外泌体：调控呼吸道平滑肌重塑的新机制。 [Am J Respir Cell Mol Biol] IF=13.20 PMID：27105177
PS：这篇文章涉及到免疫细胞来源的外泌体对呼吸道平滑肌细胞的影响，专业领域内的朋友可以关注一下。
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11. Adipocyte-derived exosomes promote lungcancer metastasis by increasing MMP9 activity via transferring MMP3 to lungcancer cells.脂肪细胞来源外泌体通过传递MMP3到肺癌细胞促进其MMP9的活性，最终促进肿瘤细胞的转移。 [Oncotarget] IF=5.01 PMID：28674209
PS：肿瘤基质细胞的成分相对比较复杂，主要包括成纤维细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、间充质干细胞、脂肪细胞等，其中脂肪细胞是肿瘤基质细胞中研究报道比较少的组分，这篇文章则关注到了脂肪细胞，同时研究的是脂肪细胞来源的外泌体所携带的蛋白成分具有的功能，值得大家了解和借鉴一下。
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另：Methods Mol Biol 最近发表了数篇新的细胞外囊泡领域的实验技术方法。这些技术方法主要涉及到的是细胞外囊泡所携带的蛋白的鉴定与分析，需要的朋友可以拿来参考一下。
A. Plasma Biomarker Identification andQuantification by Microparticle Proteomics.通过细胞外囊泡蛋白质组学分析鉴定和定量血浆中的生物标志物。Methods Mol Biol. PMID: 28674905附件已隐藏，回复该贴可查看附件
B. Surface Profiling of ExtracellularVesicles from Plasma or Ascites Fluid Using DotScan Antibody Microarrays.利用抗体芯片分析血浆或腹水来源的细胞外囊泡表面蛋白成分。Methods Mol Biol. PMID: 28674892附件已隐藏，回复该贴可查看附件
C. Proteomics Analysis of CirculatingSerum Exosomes.血液循环系统中外泌体的蛋白质组学分析。Methods Mol Biol. PMID: 28674889附件已隐藏，回复该贴可查看附件
D. Simultaneous Enrichment of PlasmaExtracellular Vesicles and Glycoproteome for Studying Disease Biomarkers.同时富集血浆中的细胞外囊泡和糖蛋白组用于分析疾病的生物标志物。Methods Mol Biol. PMID: 28674887附件已隐藏，回复该贴可查看附件
E. Targeted Approach for ProteomicAnalysis of a Hidden Membrane Protein.隐性膜蛋白的组学分析办法和靶向策略。Methods Mol Biol. PMID: 28674884附件已隐藏，回复该贴可查看附件
F. Proteomic Analysis of BloodExtracellular Vesicles in Cardiovascular Disease by LC-MS/MS Analysis.通过液相色谱-质谱连用分析心血管疾病患者血液中细胞外囊泡的蛋白质组学信息。Methods Mol Biol. PMID: 28674883附件已隐藏，回复该贴可查看附件
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今天的整理就到这里。希望大家可以有所收获。大家下周见！
作者: 哲哲 时间: 2017-7-9 17:14
多谢分享
作者: yangjw91xy 时间: 2017-7-10 00:02
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作者: liwx 时间: 2017-7-10 00:34
作者: kibana 时间: 2017-7-10 07:00
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作者: 杨云云 时间: 2017-7-10 08:20
好资料，谢谢分享！
作者: new_exosome 时间: 2017-7-10 08:36
感谢楼主，分享最近做的不太顺利啊
作者: wangjoseph 时间: 2017-7-10 08:41
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作者: YongyongDu 时间: 2017-7-10 08:53
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作者: huangwenhui1993 时间: 2017-7-10 09:00
pubmed下载不了全文 也看不了 这非常好
作者: woshiyywlly 时间: 2017-7-10 09:01
对外泌体微流控芯片非常感兴趣，学习一下
作者: wqw131343 时间: 2017-7-10 09:10
真的是相当的不错，希望看了有收获
作者: Miss神佑 时间: 2017-7-10 09:11
xiexie fenxiang
作者: 生物小博 时间: 2017-7-10 09:22
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作者: Cecellor 时间: 2017-7-10 10:14
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作者: 功夫熊猫 时间: 2017-7-10 10:32
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作者: 步步唧唧 时间: 2017-7-10 10:37
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作者: Pulisic 时间: 2017-7-10 11:03
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作者: 乌小龟 时间: 2017-7-10 11:25
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作者: 小苗 时间: 2017-7-10 11:44
很不错，可以看看学习学习喽
作者: zhousisi0223 时间: 2017-7-10 13:12
利用微流体粘弹性流动建立电场磁场非依赖性的方法从细胞外囊泡中纯化外泌体
作者: gqq 时间: 2017-7-10 14:39
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作者: wenshumm5 时间: 2017-7-10 14:50
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作者: 胖子的心境 时间: 2017-7-10 14:59
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作者: xianmao 时间: 2017-7-11 15:01
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作者: Exosomeslover 时间: 2017-7-11 19:45
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作者: idiotchou 时间: 2017-7-12 04:51
好奇分泌机理相关的文章
作者: tanxiaokathy 时间: 2017-7-12 09:41
谢谢分享
作者: 简草苍苍 时间: 2017-7-12 13:26
学习一下，今天读完
作者: songheiyuan 时间: 2017-7-12 16:56
下来看看
作者: 漂浮的米饭 时间: 2017-7-12 17:55
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作者: OIASJDHNFL 时间: 2017-7-13 19:19
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作者: ting.alina 时间: 2017-7-13 20:15
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作者: 鲜于 时间: 2017-7-14 11:02
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作者: cui 时间: 2017-7-15 08:51
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作者: Joyel 时间: 2017-7-15 09:22
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作者: baebae 时间: 2017-7-15 10:08
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作者: 木兔 时间: 2017-7-16 21:33
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作者: 程琳 时间: 2017-7-18 17:11
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作者: lixiang7520 时间: 2017-7-19 16:21
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作者: alexander 时间: 2017-7-19 17:21
謝謝樓主
作者: ttll2012 时间: 2017-7-24 02:32
谢谢 看看4
作者: pyhwq 时间: 2017-7-24 10:07
Thank you very much!
作者: FunkyWoody 时间: 2017-7-24 17:00
感谢老张！辛苦啦~
作者: Qxf 时间: 2017-7-24 18:32
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作者: zhangpengchem 时间: 2017-8-1 11:05
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作者: davidsun 时间: 2017-8-1 15:01
谢谢分享好文章
作者: atlanticocean 时间: 2017-8-8 16:07
thanks !cccc
作者: zmzhang2008 时间: 2017-8-17 21:04
谢谢分享
作者: 叶香辰 时间: 2017-8-23 10:35
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作者: anyingzhiyi 时间: 2017-8-29 14:56
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作者: 落叶知秋 时间: 2017-9-14 17:07
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作者: ldl681656 时间: 2017-9-18 10:58
X谢谢分享
作者: 外小白 时间: 2018-1-28 18:07
谢谢分享
作者: TZHANG16 时间: 2018-2-3 14:53
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作者: 故人老 时间: 2018-2-8 00:09
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作者: zerokatana 时间: 2018-2-8 08:58
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作者: 功夫熊猫 时间: 2018-5-30 10:50
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作者: 溪澈冰清 时间: 2018-7-22 15:56
谢谢分享
作者: ERIC 时间: 2018-7-23 20:07
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作者: 15006181200 时间: 2018-7-24 09:23
谢谢了，博主！
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