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标题:
hzangs关于凝胶排阻(SEC)外泌体分离方法优缺点的理解
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作者:
hzangs
时间:
2018-1-3 22:49
标题:
hzangs关于凝胶排阻(SEC)外泌体分离方法优缺点的理解
本帖最后由 hzangs 于 2018-1-4 00:05 编辑
多年前hzangs曾经写过一篇关于凝胶排阻分离外泌体的试用总结,本已声明仅用于科研交流,但不想被人拿去做了商业宣传,一怒之下删之……
但内容还是被截图保存了,一直有人拿我之前写的东西做宣传,同时这几年来论坛里也一直时不时有朋友问我SEC分离柱的优缺点问题。那我就在这里再汇总一下这几年关注凝胶排阻(SEC)外泌体分离方法所获得的新的认识。主要是总结一下优缺点。
以后大家不要再私信问我了哦
关于SEC分离方法的优缺点,这个要放到特定的时间来看。我之前对SEC方法的评价很多都是在多年前说的。之前对SEC方法的试用也是很多年前的事情了。当时文献报道非常少,同时研究方法也十分有限。
近年随着关于SEC方法的报道越来越多,尤其是今年下半年数篇文章报道的出现,也逐渐暴露了SEC方法的一些问题。目前看基于SEC进行外泌体分离存在以下几个缺陷:
1、上样量小,浓缩样品、处理、洗脱等耗时不比超离少。超离只需要每次大约20~30min的处理时间,超离过程可以去做其他事情;但SEC分离需要浓缩样品、洗脱时要全程关注着,洗脱完还要浓缩洗脱液。
2、纯度问题,SEC没有办法排除一些与外泌体大小相近的颗粒,例如大的蛋白复合体、血清中的脂蛋白颗粒,没办法去除一些与外泌体大小相当的结构;这是最致命的缺点。SEC最佳适用场景就是血清外泌体分离,但是它没办法去除脂蛋白颗粒(通常直径在几十纳米)及其他大结构的污染。 (血清中脂蛋白量比外泌体量高两三个数量级,哪怕1%的脂蛋白残留,样品依旧大部分是脂蛋白…)
3、相对其他方法而言 操作复杂,很多朋友使用后检测不到外泌体的存在。多数方法要么收沉淀要么收上清,但SEC方法需要你收集特定的中间组分。
4、部分基于SEC原理的产品分离得到的囊泡直径偏大;
5、自己装SEC柱,相对需要比较多的实验技巧。
6、产率和纯度看上去并没有比超离好(这一点是hzangs基于个人阅读paper和综述的理解,不同人可能有不同观点)。
当然,优点还是有的,它可以不需要离心机!纯度和普通超离的效果相当(这是hzangs基于阅读一些文献后的个人观点,不同人可能有不同观点)。
SEC方法有其特定的适用场景,但是由于上述优缺点的制约,目前看依旧不是主流,是一个相对小众的方法,在2017年一份由ISEV开展的调查问卷中,统计结果显示只有10%-15%的研究人员使用过该方法。
根据MISEV2014(对 2014年发表的,比较老了… 最近在征求更新意见,跟新之后我会再关注)的说法:目前不存在最好的外泌体分离方法,目前还没有哪种方法可以做到很好的分离到十分纯净的外泌体,因此需要结合下游实验综合考虑使用什么方法纯化外泌体”。
个人观点 仅供参考
声明:hzangs个人与所有外泌体相关试剂产品企业无任何利益关系。
作者:
zx190214
时间:
2021-3-31 20:48
求问大神,SEC洗脱后,洗脱液应该怎么浓缩?最近尝试SEC法,浓度太低了,wb应该做不出来,好痛苦
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