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标题: 外泌体测序——肿瘤液体活检新宠儿 [打印本页]
作者: 土豆 时间: 2016-4-28 16:41
标题: 外泌体测序——肿瘤液体活检新宠儿
本帖最后由 土豆 于 2016-4-28 16:43 编辑
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通过液体活检对遗传物质进行测序有望成为癌症诊断的最重要的方法之一。相对于直接的肿瘤活检，液体活检的相对简便以及微创的特性使得检测肿瘤DNA成为一个更有吸引力的替代方式。在临床上获得活检或手术的材料非常困难或者几乎不可能的情况下，通过检测肿瘤遗传物质信息的液体活检将会变得非常重要。但是，利用用于诊断目的的可溶、游离的DNA仍存在很多缺陷，尽管在该领域已有些有价值的进展。肿瘤来源的游离DNA的比例与体内总的循环游离DNA的数量变化密切相关，但是其数量太少，远远不能达到能够检测原位肿瘤所需要的的基因组规模（全基因组或全外泌体）的二代测序的用量。本杂志（Annals of Oncology）的最新一期的文章里提出了一种有趣的、基于外泌体的替代方式，以获得肿瘤来源的DNA或RNA来进行二代测序。
外泌体是一种非常小、30-100nm的细胞分泌的囊泡，并且在30年前被生物学家首次发现。之后，外泌体研究成为了现代生物学中最令人兴奋、令人惊讶的研究领域之一。与其他种类的细胞衍生物不同，外泌体在整个生物过程包括细胞间通讯中发挥重要作用。最近，研究报道外泌体连接整合素在肿瘤转移的器官靶向性中发挥中心作用。更为重要的是，外泌体可以包裹双链的大DNA片段（大于2.5kb，也许甚至于10kb以上）。此外，外泌体中还包含大量的RNA，无论是miRNA还是mRNA都可以很容易通过二代测序进行分析。由于外泌体内的DNA和RNA不像血清中的游离肿瘤DNA那样极度分散，使得外泌体成为肿瘤基因组测序的很有吸引力的目标。另外，肿瘤来源的外泌体也可以显著在各种生物体液内富集。综合以上以及更多其他研究，可以认为外泌体DNA和RNA是一种可靠的进行肿瘤诊断的测序材料。
图：循环肿瘤DNA中的遗传改变可被检测。肿瘤细胞可通过多种机制释放cfDNA（cell-free DNA）进入循环系统。通过检测循环的cfDNA，与癌症相关的
遗传改变均可被检测，比如点突变、拷贝数改变、染色体重排以及DNA甲基化等。
参考文献：Szallasi Z. (2016) Another surprising role for exosomes? Improving next-generation sequencing-based cancer diagnostics in liquid biopsies. Ann Oncol 27(4):557-8. [abstract]
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作者: 土豆 时间: 2016-4-28 16:43
Another surprising role for exosomes? Improving next-generation sequencing-based cancer diagnostics in liquid biopsies.
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