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标题: 【2016.6.24】This Week in Extracellular Vesicles [打印本页]
作者: hzangs    时间: 2016-6-24 20:33
标题: 【2016.6.24】This Week in Extracellular Vesicles
本帖最后由 hzangs 于 2016-6-24 20:55 编辑

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本周hzangs在最新文献中选取了5篇分享给大家，其中4篇提供了中文摘要。这周的内容主要涉及了外泌体释放机制调控、外泌体标记新方法、外泌体分离方法对比等方面以及一组前列腺癌细胞系与对应外泌体中lncRNA差异分析数据集。相关文章的原文都在论坛同名贴下，需要的可以到论坛下载。

1.       Identifying the functional contributionof the defatty-acylase activity of SIRT6.SIRT6脂肪酸脱酰基酶活性的鉴定. [Nat Commun] IF=12.709  PMID：27322069
摘要：哺乳动物的sirtuin6（SIRT6）表现出很多关键功能和多种酶活性，但是不同的活性对不同功能的作用还不是很清楚。我们发现SIRT6（G60A）突变会提升脂肪酸脱酰基酶活性而降低乙酰化酶活性。G60A突变会降低NAD+的结合能力，而脂肪酸赖氨酸肽的存在会恢复NAD+的结合能力，这说明脱脂肪酸酰基酶活性还存在。使用这一突变型SIRT6，我们发现SIRT6脂肪酸脱酰基酶活性调控着多种蛋白的分泌。值得注意的是，在SIRT6敲除的小鼠胚胎成纤维细胞中，许多核糖体蛋白会通过外泌体被分泌出去，而这些外泌体可以增强NIH 3T3细胞的增殖。我们的数据表明SIRT6不同的活性调控了不同的信号通路，G60A突变是研究SIRT6脂肪酸脱酰基酶活性对多种功能调控的有力工具。
PS：文章讲述了SIRT6突变增强脂肪酸脱酰基酶活性降低乙酰化酶活性后的一些变化。该变化带来了外泌体内容物的变化并在体外对细胞生长产生影响，这可能一定程度上暗示着外泌体内容物的分选机制，感兴趣的可以好好读读。
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2.       A novel TP53 pathway influences theHGS-mediated exosome formation in colorectal cancer.在结直肠癌中TP53的一个新通路影响着HGS介导的外泌体形成。 [Sci Rep] IF= 5.228  PMID：27312428
摘要：肿瘤来源的外泌体对细胞间通讯非常重要。然而，TP53在结直肠癌（CRC）中调控外泌体产生的作用尚不清楚且有争议。本文评估了从HCT116 TP53野生型（WT）、TP53基因敲除（KO）和TP53（R273H）突变（MT）细胞分泌外泌体的特点。MT和KO细胞分泌的外泌体与野生型细胞分泌的外泌体相比，表现出显著的尺寸减小。使用同位素标记的相对和绝对定量的质谱（iTRAQ-2D-LC-MS/MS）对外泌体蛋白进行全面的蛋白质组学分析，共鉴定了3437种蛋白质。肝细胞生长因子调控的酪氨酸激酶底物（HGS）在MT和KO细胞分泌的外泌体中表达下调。功能研究表明，低水平的HGS会导致外泌体直径变小。TP53调控HGS表达，进而调节HGS依赖的外泌体形成。此外，HGS表达逐渐增高伴随着结直肠癌的发生，是一个独立的预后不良因素。总之，本研究鉴定了CRC外泌体形成中一种新颖的HGS依赖性TP53机制。 HGS可作为一种新的预后生物标志物并可用于治疗性干预的潜在靶点。
PS：文章发现了TP53对外泌体分泌的影响，感兴趣的可以看一看。
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3.       Magnetic resonance imaging ofultrasmall superparamagnetic iron oxide-labeled exosomes from stem cells: a newmethod to obtain labeled exosomes.超微超顺磁性氧化铁标记干细胞来源的外泌体用于核磁共振成像：一种新的标记外泌体的方法。[Int J Nanomedicine] IF=4.32。 PMID: 27330291
摘要：最近的研究表明，脂肪干细胞（ASCs）可以利用旁分泌作用通过外泌体对几种神经退行性疾病模型具有改善作用。本研究的目在于开发一种新型的外泌体标记方式用于核磁共振（MR）成像。首先，我们使用超微超顺磁性氧化铁（USPIO，4-6 nm）标记ASCs，优化参数使其对ASCs细胞活力影响最小，而标机效率和MR图像质量较高。使用标准分离方法分离被标记ASCs分泌的外泌体。利用体内体外MR成像效果及外泌体中含铁量来衡量标记效率，利用透射电子显微镜图像和组织学分析验证所获得的结果。利用ASCs标记的最佳条件（200µg Fe/mL USPIO 孵育72小时）标记ASCs，该条件可以标记100%的细胞，而对细胞活性几乎无影响；MR成像检测到细胞信号的下限在体外是100个细胞而体内是2500个细胞。被标记的ASCs分泌的外泌体在电镜下可以看到外泌体形态，MR成像检测到外泌体信号的下限在体外是3ug而体内是5ug。综上所述，我们开发了一个新的用于在保证细胞和外泌体完整性及生理特性的前提下标记它们并用于MR检测的方法。
PS：一篇外泌体标记方法的文章。文中使用了超微超顺磁性纳米铁颗粒标记细胞再通过细胞进入外泌体，从而达到标记外泌体并利用核磁共振检测的目的，这是一种较为新颖的标记方法，但是看上去相对复杂并且需要使用核磁共振，有条件并对这方面感兴趣的朋友可以读一读。
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4.       A comparative analysis of lncRNAs inprostate cancer exosomes and their parental cell lines.全面的分析对比前列腺癌外泌体中lncRNA与其母细胞的异同。[Genom Data] IF=？. PMID: 27330995
摘要：前列腺癌是世界范围内男性的第二大癌症。由于其异质性，目前大量的研究致力于从蛋白、信使RNA、miRNA水平寻找有效的临床生物标志物。然而，目前前列腺癌外泌体中lncRNA表达水平的数据很有限。该数据集是我们之前文章中使用的人源lncRNA在5个不同的前列腺癌细胞系及其外泌体中的表达水平。这个数据集中我们整理出一个清单，清单中罗列了在前列腺癌细胞和其对应外泌体中表达具有显著差异的的lncRNA，以上所有数据均已储存到Gene Expression Omnibus（gse81034）。
PS：这是一个数据集，里面是5个前列腺癌细胞系及其对应外泌体中lncRNA丰度的分析数据，并且汇总了具有明显差异的lncRNA，有计划研究前列腺癌外泌体lncRNA又不打算进行大规模测序的朋友可以将这个数据集用于分析。
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5.       Exosome-like vesicles in uterineaspirates: a comparison of ultracentrifugation-based isolation protocols.子宫分泌物中的外泌体样囊泡：几种超速离心分离方法的比较。[Journal of translational medicine] IF=3.694.PMID: 27317346
PS：该文章主要介绍了使用标准超速离心、超滤离心、蔗糖垫离心法分离子宫分泌物中外泌体样囊泡效果对比结果。属于讨论分离方法的文章，感兴趣的可以读一读，这里不再提供摘要翻译。
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今天的整理就到这里。希望大家可以有所收获。大家下周见！

作者: 采菇凉的流氓兔    时间: 2016-6-24 22:29
赞一个版主辛苦了1111111111111111111
作者: Mr.WD    时间: 2016-6-26 14:48
不错哦,可以了解一下，
作者: 下里巴人    时间: 2016-6-27 09:30
32个赞！每周的分享都很棒！
作者: 墨清    时间: 2016-6-27 09:35
感谢楼主分享
作者: vera    时间: 2016-6-29 17:21
感谢分享~
作者: 微微一笑    时间: 2016-7-1 09:09
学习！！！！！！！！！
作者: nyg1234    时间: 2016-7-2 19:50
谢谢，谢谢
作者: yuebingyun    时间: 2016-7-3 18:14
谢谢分享~
作者: 张艳琦    时间: 2016-7-4 08:36
谢谢！赞一个！
作者: shop2230    时间: 2016-7-5 15:37
谢谢分享！
作者: katekitekite    时间: 2016-7-6 14:52
楼主  抱走啦
作者: 丝瓜    时间: 2016-7-6 22:03
每周一总结很棒！
作者: josephinebyzy    时间: 2016-7-7 21:11
谢谢分享
作者: 圣裤裤    时间: 2016-7-7 22:56
想看看提取对比的文献 楼主辛苦了
作者: woshiyywlly    时间: 2016-7-8 15:02
非常感谢
作者: xinyi717    时间: 2016-7-13 12:41
感谢分享
作者: 赵晶晶    时间: 2016-7-13 14:02
版主辛苦了，会继续支持！
作者: shisifu    时间: 2016-7-13 14:50
漂亮,感谢楼主分享
作者: derek    时间: 2016-7-20 23:52
谢谢楼主
作者: ceiba    时间: 2016-8-10 08:18
赞一个！
作者: 大琳宝儿    时间: 2016-8-31 09:07
作者: 叶香辰    时间: 2016-10-11 17:12
学习下，感谢分享！
作者: WRL1215    时间: 2016-11-1 16:50
谢谢分享
作者: yilin99    时间: 2016-11-3 00:36
xieixiefenxiang
作者: 不二    时间: 2017-1-1 23:16
very good 非常有用
作者: meiling    时间: 2017-3-10 20:20
看起来好复杂的样子
作者: 胖子的心境    时间: 2017-3-31 15:29
感谢分享
作者: pyhwq    时间: 2017-7-24 10:47
Thank you!
作者: zmzhang2008    时间: 2017-8-17 22:08
谢谢分享
作者: likun197289    时间: 2017-10-7 19:03
我希望看到这篇文章。非常感谢！
作者: likun197289    时间: 2017-10-7 19:04
我希望看到这篇文章。非常感谢！
作者: ldl681656    时间: 2018-1-8 09:30
谢谢分享！
作者: TZHANG16    时间: 2018-2-3 18:30
谢谢分享
作者: yyyyy    时间: 2018-5-19 23:58
谢谢hzangs！
作者: 功夫熊猫    时间: 2018-5-30 14:28
谢谢分享
作者: wt18229755198    时间: 2020-9-21 23:07
感谢分享最新研究进展。



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