关于质谱exosome or EVs的marker

seallin

丝瓜 发表于 2016-5-25 20:44
你好，我的实验也是做蛋白方面的。只是我做血清想做绝对定量的质谱，可是了解下来需要的蛋白量都非常大~~ ...

看你用什么方法了，基于质谱的绝对定量不需要太多的样品，几微克足够了

丝瓜

seallin 发表于 2016-4-24 15:41
我是专门做质谱的，回答这个问题主要分两点：
1、外泌体的提取。这个很关键，因为外泌体在培养液里，一般质 ...

你好，我的实验也是做蛋白方面的。只是我做血清想做绝对定量的质谱，可是了解下来需要的蛋白量都非常大~~想问你做的那边是多少量呢

minling1977

seallin 发表于 2016-5-5 14:08
RNA这块我不是很擅长，所以也解决不了你的问题~~祝好运

提外泌体的RNA需用专用的小RNA提取试剂盒，可联系美基生物黄经理：13660481570

seallin

子非鱼 发表于 2016-5-5 22:27
大神，问题来了：，我的质谱数据是一堆Accession number（蛋白gi号）和蛋白或多肽全称，我想把它 ...

很多网站是可以转化的，比如uniprot.org

子非鱼

seallin 发表于 2016-5-5 16:51
不用客气，大家共同提高，文章才刚刚接收，还没出来呢，等出版了再发给你哈。有蛋白组学、质谱方面的问题 ...

请问，有没有什么软件可将蛋白gi号批量转换为GeneID和gene symbol的？

子非鱼

seallin 发表于 2016-5-5 16:51
不用客气，大家共同提高，文章才刚刚接收，还没出来呢，等出版了再发给你哈。有蛋白组学、质谱方面的问题 ...

大神啊~~那文章出版了别忘记发给我；我先分析我的数据，有问题还真得向您请教！

微泡biomarker

seallin 发表于 2016-5-5 16:33
血清其实就是将培养液浓缩10倍的东东，差不多，由于血清量一般比较少，所以清洗次数差不多就行，量最好不 ...

能不能分享一下 文章的题目啊

seallin

子非鱼 发表于 2016-5-5 16:43
太好啦~~祝贺您！！之前还在想跟您要paper之类的...可以把您的paper发过来或者paper链接也行，我想学习学 ...

不用客气，大家共同提高，文章才刚刚接收，还没出来呢，等出版了再发给你哈。有蛋白组学、质谱方面的问题可以联系我

子非鱼

seallin 发表于 2016-5-5 16:33
血清其实就是将培养液浓缩10倍的东东，差不多，由于血清量一般比较少，所以清洗次数差不多就行，量最好不 ...

太好啦~~祝贺您！！之前还在想跟您要paper之类的...可以把您的paper发过来或者paper链接也行，我想学习学习！我邮箱：jokololo@163.com
Ps：血清exo用SBI提取后就是淡黄色的，所以铁定是不纯的了，多谢您的指点！！

seallin

微泡biomarker 发表于 2016-5-5 15:57
您好：  感谢您的回复，我们现在一般质谱样本制备的方式都是FASP 酶解，溶液体系是碳酸氢铵。加DTT 和IAA ...

没错，FASP对于去燥效果特别好。兼容含NP40和SDS体系，我也是推荐用这个。另外PEG沉淀法不可避免的会引入PEG的干扰，所以FASP比较合适。后续的变性还原烷基化步骤，正如你所说，你说的很正确。