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【2017.11.26】This Week in Extracellular Vesicles

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发表于 2017-11-26 20:26:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式

本周hzangs在最新文献中选取了12 篇分享给大家,本周有大量的综述,粗略看了一下,大概有8篇吧。这周的文章只强调一点吧,大家在做外泌体研究的是时候,还是要先考虑采取什么样的外泌体纯化手段,现在越来越多的高水平刊物开始关注这个点了,聚合物沉淀的方法可能越来越被质疑了!相关文章的原文在周一前会发布到论坛同名贴下,需要的可以到论坛下载。


1.   Exosome Treatment of Bronchopulmonary Dysplasia. How Pure Should Your Exosome Preparation Be?. 外泌体用于治疗肺支气管发育不良:你准备的外泌体需要有多纯净。 [Am J Respir Crit Care Med] IF=13.20  PMID:29160724
2.  Reply to: Exosome Treatment of Bronchopulmonary Dysplasia. How Pure Should Your Exosome Preparation Be?.答复:外泌体用于治疗肺支气管发育不良:你准备的外泌体需要有多纯净。 [Am J Respir Crit Care Med] IF=13.20  PMID:29160730

PS:两篇一问一答的讨论文章。放在一起介绍。文章考虑的主要问题是,如果使用外泌体用于肺部疾病治疗,外泌体的制备应该如何考虑纯度和产量之间的平衡关系。讨论的文章中其实使用了目前最为认可的梯度密度离心来分离外泌体,但是提出质疑的人依旧在质疑梯度密度离心会携带一些凋亡细胞的细胞器进入所谓的“外泌体”样品中。

借着这两篇讨论,hzangs在这里再强调一下外泌体样品纯度的问题!外泌体纯度是目前研究中最重要的问题!从hzangs目前对文章的追踪,hzangs发现现在越来越多的高水平刊物开始发表综述或者讨论来点明这个问题。目前看,这些刊物的态度还比较低调平和,但是随着使用一些不纯的囊泡样本发表的水文越来越多,相信高水平刊物的态度会越来越强硬。刚刚开始从事外泌体相关研究的朋友一定要开始考虑自己采用的纯化方法了。外泌体领域走到今天,已经不是用聚乙二醇配瓶溶液,沉淀一堆杂蛋白说里面有外泌体,就拿这个杂质开始做研究的时代了,很难再用一些不严谨的分离方法来发表文章了。如何提纯外泌体,如何验证你所关注的现象是外泌体带来的,这些已经是非常重要的事情了。前几天和一个在投文章的朋友也讨论了这个问题,他的确也被reviewer质疑了样品的纯度。大家一定要考虑考虑这个问题!

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3. Extracellular vesicle-mediated cell-cell communication in haematological neoplasms.血液肿瘤中细胞外囊泡介导的细胞间通讯.。 [Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci] IF=5.85  PMID:29158313(讨论会议“细胞外囊泡和肿瘤微环境”的一部分。)

摘要:骨髓瘤细胞与其周围基质细胞(包括骨髓间充质干细胞(BM-MSC),内皮细胞和免疫细胞)之间的交互通信对于血液肿瘤的生长是重要的。近年的研究发现除了常规的信号传导途径之外,还存在细胞外囊泡介导的信号传递过程,胞外囊泡(EV)是含有蛋白质,mRNA,脂质和miRNA的内体衍生囊泡,可以促进骨髓微环境的调节而不直接接触非肿瘤细胞。在这篇综述中,我们讨论目前对血液肿瘤特别是白血病和多发性骨髓瘤中EV介导的细胞间通讯的理解。我们强调了肿瘤和BM-MSC来源细胞外囊泡在多发性骨髓瘤中的作用。细胞外囊泡的起源,细胞外囊泡转移的倾向性和作用机制正在成为细胞外囊泡在血液肿瘤中介导的细胞间通讯作用研究中亟需解决的新问题。

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4.  Functional role of extracellular vesicles and lipoproteins in the tumour microenvironment. 细胞外囊泡和脂蛋白在肿瘤微环境中的功能作用。 [Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci] IF=5.85 PMID:29158310 (讨论会议“细胞外囊泡和肿瘤微环境”的一部分。)

摘要:癌症可以被认为是一种侵袭性的病态器官,其表现出由肿瘤微环境中协调的癌细胞 - 基质细胞通信提供的独特可塑性。缺氧和酸中毒等典型的应激因素是这些事件的主要驱动因素和调节因素。最近的研究结果揭示了细胞外囊泡和脂蛋白在癌细胞适应外源性应激中的重要作用。适应性机制包括刺激血管生成和增加转移。在这里,我们将讨论这些内源性纳米颗粒的相似性和独特特征以及它们在癌症细胞的信号感知和营养摄取方面的作用。我们将重点研究细胞表面硫酸乙酰肝素蛋白多糖在摄取细胞外囊泡和脂蛋白方面的核心作用。

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5.  Why the need and how to approach the functional diversity of extracellular vesicles.为什么需要考虑细胞外囊泡的功能多样性,如何处理细胞外囊泡的功能多样性。 [Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci] IF=5.85 PMID:29158309(讨论会议“细胞外囊泡和肿瘤微环境”的一部分。)

摘要:在过去的十年中,由外泌体介导的细胞间通讯已经引起了生物医学科学家和医生的日益关注,最近在顶级期刊上发表了几篇文章。外泌体通常定义为细胞分泌的膜囊泡或胞外囊泡(EV),其对应于细胞内晚期内体腔室中的腔内囊泡,其在多泡状内涵体与细胞质膜融合时分泌。然而,研究也显示细胞会释放其他类型的细胞外囊泡,例如,直接从细胞质膜萌芽的囊泡。这些细胞外囊泡中的一些与外泌体共享主要的生物物理学和生物化学特性,例如尺寸,密度和膜定向,这在目前的分离方法中很难进行有效的区分分离。尽管在文献中经常有人声称外泌体有某种功能,但外泌体否真正显示出更重要的病理/生理功能,或者具有比其他细胞外囊泡更高的诊断或治疗工具的潜力,目前还没有令人信服地证据。在这篇文章中,我们描述了细胞外囊泡领域目前阶段缺乏精确知识的原因,我们回顾了近期描述的解决这些问题的方法,并提出了改进我们对不同细胞外囊泡各自功能认知的方法,这对于未来细胞外囊泡临床应用的发展至关重要。

PS:这篇文章强调了细胞外囊泡的来源多样性和功能多样性的问题。直指目前很多文章经常忽略的问题,即:纯化的囊泡样品是不是外泌体,含不含其他膜泡亚群。讨论了外泌体是否真的比其他类型的细胞外囊泡更具应用潜力。

3-5是三篇综述文章,是“细胞外囊泡和肿瘤微环境”会议的会刊。

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6.  A signal-amplifiable biochip quantifies extracellular vesicle-associated RNAs for early cancer detection. 可扩增信号的生物芯片定量细胞外囊泡相关的RNAs用于早期癌症检测。 [Nat Commun] IF=11.33  PMID:29162835

摘要:虽然在早期癌症中低表达水平的细胞外囊泡(EV)相关RNA的检测仍然是一个挑战,但是目前的研究结果表明这一检测非常有价值。在这里,我们介绍了一种基于纳米粒子的生物芯片,该系统可以在不经纯化步骤的条件下捕获循环系统中的细胞外囊泡,检测封装在内部的RNA,并在一个步骤中对荧光信号进行方法。我们将催化的发夹DNA结构(CHDC)限制在拴在芯片上的阳离子脂质 - 聚合物混合纳米颗粒(LPHN)中。 LPHN具有核 - 壳 - 电晕结构,其在形成LPHN-EV纳米复合物时促进CHDC与EV相关RNA的转移和混合。目标RNA结合后触发CHDC,并迅速产生放大的信号。 LPHN-CHDC的信号放大效率在人造EV,癌细胞和癌细胞衍生的EV中得到证明。我们发现具有信号放大能力的LPHN-CHDC生物芯片能够选择性和敏感地识别血清EV中的低表达磷脂酰肌醇蛋白聚糖-1 mRNA,区分患有早期和晚期胰腺癌的患者与健康供体和良性胰腺疾病患者。

PS:这篇文章介绍了一种细胞外囊泡中的RNA检测手段,是一种基于纳米粒子的检测芯片,对hzangs来说,专业跨度有点大,就不多介绍了,相似领域的朋友可以关注一下。

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7.  The Biology of Cancer Exosomes: Insights and New Perspectives. 癌症外泌体生物学:见解与新视角。 [Cancer Res] IF=8.56  PMID:29162616

摘要:外泌体是参与细胞间通讯的细胞外囊泡的一个亚类,由所有细胞类型包括癌细胞释放。 癌症外泌体携带可调整受体细胞生物特性的蛋白质,脂质和核酸形式的生物信息。 外泌体已经被认为是癌症发生发展过程中的重要生物介质,对癌症的进展发挥着重要作用。 癌症外泌体在肿瘤进展的特定方面存在主导作用如:调节免疫应答,肿瘤微环境重编程和转移。 这篇综述将阐述癌症来源外泌体在癌症生物学的这三个方面作用,并突出了最近的进展和潜在的不足之处。 最后,我们探索替代策略来开发更好的模型来研究癌症外泌体生物学。

PS:目前外泌体领域来看,肿瘤来源的外泌体、间充质干细胞来源外泌体和脂肪细胞来源的外泌体是研究比较集中的三个领域。这篇发表在cancer research上的综述着重关注了肿瘤来源外泌体的研究进展。新进入该领域的朋友可以拿来读读。

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8.  Lactadherin Promotes Microvesicle Clearance to Prevent Coagulopathy and Improves Survival of Severe TBI Mice. Lactadherin促进微囊泡清除并预防凝血病,改善严重创伤性脑损伤小鼠的存活情况。 [Blood] IF=11.84  PMID:29162596

摘要:创伤性脑损伤(TBI)患者中伴有凝血障碍是比较常见的,这一类病人的预后不佳。我们研究已经发现,脑源性细胞外微囊泡,包括细胞外线粒体,在TBI诱导的凝血病的发展中起关键作用。在这里,我们进一步揭示在小鼠模型中,在脑液冲击损伤前30分钟或30分钟之后以400μg/ kg的单一剂量给予的凋亡细胞清除因子——乳凝集素,防止了由凝血时间所定义的凝血病,纤维蛋白溶解,血管内纤维蛋白沉积和肺的微血管出血。乳凝集素还可以减轻脑水肿,改善神经功能,提高生存率。进一步研究发现这一改善效果是通过磷脂酰丝氨酸介导的吞噬作用增强循环微泡的清除,从而达到了这些保护作用。总之,这些结果确定了凋亡细胞的清除系统作为预防TBI诱导的凝血病和改善TBI结果的潜在治疗靶标。

PS:一篇报道微囊泡功能的文章,作者前期研究发现脑源性细胞外微囊泡是诱发创伤性脑损伤凝血障碍的关键因素,基于这一发现作者使用了乳凝集素刺激来改善机体对脑源性微囊泡的清除,从而改善了预后。这一研究是在小鼠模型中实现的。文章提到了磷酯酰丝氨酸介导的吞噬对微囊泡的摄取清除作用,这一过程在一些文章中曾被用于一定程度上抑制囊泡被靶细胞的摄取。方法是使用磷酯酰丝氨酸抗体屏蔽受体细胞,从而降低摄取。有需要抑制靶细胞对囊泡摄取的朋友可以考虑使用这个方法。

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9.  Extracellular vesicles compartment in liquid biopsies: Clinical application. 液体活检中的细胞外囊泡:临床应用。 [Mol Aspects Med] IF=10.86  PMID:29155161

摘要:液体活检正在成为生物标记物的新来源,这些生物标记物补充并解决了手术活检的一些最重要的局限性,即特别是与肿瘤有关的对病变组织的可及性及其异质性问题。病变组织以游离形式,细胞或细胞外囊泡(EV)形式释放它们的分子到血流中。尽管分离自外周血的总DNA中的分子改变的鉴定已经用于分析一些大量释放DNA的肿瘤类型中,但是分析分泌较少的那些分子以及许多其他非肿瘤病理学如免疫学和心血管疾病还相对比较困难。在这样的病例中,病变组织来源的细胞外囊泡将是在这些疾病的临床管理中新的生物标志物和靶标的最佳替代物之一。在这里,我们回顾细胞外囊泡分子内在化机制,以及EV的货物与临床参数在肿瘤和非肿瘤疾病的相关性,并特别强调临床应用。

PS:一篇偏向于应用的细胞外囊泡综述,主要回顾的是细胞外囊泡在体液活检领域的研究进展,以及未来的临床应用优势等。


10.  Target-induced proximity ligation triggers recombinase polymerase amplification and transcription-mediated amplification to detect tumor-derived exosomes in nasopharyngeal carcinoma with high sensitivity.目标诱导的接近性连接触发重组酶聚合酶扩增和转录介导的扩增进行信号放大以高灵敏度检测鼻咽癌中的肿瘤来源的外泌体。 [Biosens Bioelectron] IF=7.48  PMID:29145073

摘要:肿瘤来源的外泌体(TEXs)是由肿瘤细胞不断释放到血液中的细胞外囊泡,并携带原始肿瘤细胞的特定表面标记。大量证据表明TEXs是癌症诊断的标志物载体。然而,在早期肿瘤阶段检测血液中的TEXs由于其浓度非常低而具有挑战性。在这里,我们建立了一种称为PLA-RPA-TMA测定的方法,可以使TEXs以高灵敏度和特异性进行检测。基于识别TEX上生物标志物的两种邻近连接测定(PLA)探针,我们产生了替代特异性生物标志物的独特DNA信号,其通过与转录介导的扩增(TMA)结合重组酶聚合酶扩增(RPA)进行两次信号放大,然后使用基于金纳米颗粒的比色测定法定量检测RPA-TMA反应的产物。我们使用来自鼻咽癌(NPC)细胞的TEX,建立了这种方法的验证数据,检测限为102个/ mL,并且报道了血浆EB病毒潜伏膜蛋白1(LPM1)阳性(LMP1 +,准确性:0.956)和表皮生长因子受体(EGFR)阳性(EGFR +,准确度:0.906)TEXs可作为NPC的早期诊断生物标志物。

PS:检测技术的报道文章,用于高灵敏性检测特定外泌体。

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11.   Melatonin alleviates adipose inflammation through elevating α-ketoglutarate and diverting adipose-derived exosomes to macrophages in mice. 褪黑激素通过提高α-酮戊二酸并且将脂肪衍生的外泌体转移至小鼠中的巨噬细胞来减轻脂肪炎症。 [J Pineal Res] IF=9.31  PMID:29149454

PS:介绍褪黑激素通过提升α-酮戊二酸和脂肪外泌体清除来减轻脂肪炎症的报道,相关领域的朋友可以读读。

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12.  Emerging role of extracellular vesicles as a senescence-associated secretory phenotype: Insights into the pathophysiology of lung diseases.细胞外囊泡作为衰老相关分泌表型的新作用:洞察肺疾病的病理生理学。 [Mol Aspects Med] IF=10.86 PMID:29146100

PS:综述!细胞外囊泡!衰老相关分泌表型!(我 秦始皇 钱)。Hzangs写不动了,这是本周的又一个高分综述。相关! 人员! 看! O(∩_∩)O哈哈~!

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今天的整理就到这里。希望大家可以有所收获。大家下周见!


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