本帖最后由 hzangs 于 2016-8-5 22:11 编辑
本周nature nanotechnology刊发一篇关于外泌体筛选的新技术文章,相信这一技术将极大的推动外泌体液体活检的应用。推荐从事应用研究的朋友了解一下。hzangs在最新文献中选取了8篇分享给大家,其中6篇提供了中文摘要。这周的内容主要涉及外泌体筛选芯片技术、外泌体与肿瘤诊断治疗、外泌体分离鉴定方法等。相关文章的原文都在论坛同名贴下,需要的可以到论坛下载。
1. Nanoscale lateral displacement arraysfor the separation of exosomes and colloids down to 20 nm. 纳米级横向位移分离芯片可分离体液中小至20nm的外泌体、胶体组分。 [NatNanotechnol] IF=35.267 PMID:27479757 摘要:定向侧向位移(DLD)柱列阵芯片是高效分离和富集微米级颗粒如寄生虫、细菌、血细胞和循环肿瘤细胞的工具。然而,这一工具一直没有成为真正用于液体活检分离诸如外泌体等纳米粒子的纳米级分离工具。目前外泌体研究的一个主要难点在于便捷地依据大小和表面标志物分选出外泌体。我们利用目前硅芯片的制造工艺制造了一款柱间距25nm~235nm的纳米级定向侧向位移柱阵列芯片(nano-DLD),该芯片对于直径在20nm~110nm的粒子具有很高的分辨率。进一步,我们展示了该芯片分离外泌体的能力,这一结果表明该芯片具有分选和定量纳米级生物粒子的应用潜力。 PS:IBM的工程师开发的纳米级粒子筛选芯片。这一原理已经用于分选血液中的循环肿瘤细胞很长时间了,一直是一个微米级的筛选芯片,但是IBM的工程师利用计算机芯片制造工艺造就了这么一个纳米级的芯片,直接从细胞分选推进到了微囊泡的分选。电脑工程师不务正业就会出现这样的开挂产品。将计算机芯片制造工艺应用到液体活检样品分选中的鲜活案例。感兴趣的可以读一读全文。 附分选原理视频:http://static.video.qq.com/TPout.swf?auto=1&vid=b0318jqpes3
2. Shipping Drug Resistance: ExtracellularVesicles in Ovarian Cancer.耐药性的承载者:卵巢癌来源的细胞外囊泡。 [Trends Mol Med] IF=9.292。 PMID: 27474394 PS:这是对之前发表于 nature communication的一篇囊泡方面的论文的评述,感兴趣的可以读一下这篇NC的文章,该文章在4月1日的周总结中有介绍。摘要-晚期卵巢癌细胞通常会发生大网膜脂肪组织处的转移,但是网膜基质细胞来源的分子对卵巢癌生长的影响还未见太多报道。本文中,我们通过二代测序技术发现肿瘤相关的脂肪细胞和成纤维细胞中miR21的表达量明显高于卵巢癌细胞。通过功能研究发现,肿瘤相关的脂肪细胞和成纤维细胞的miR21可以转移到卵巢癌细胞中,从而抑制卵巢癌细胞的凋亡并通过结合一个新发现的靶mRNA—APAF1 赋予其化疗抗性。这些数据表明,转移性卵巢癌细胞的恶性表型可通过从相邻的网膜基质细胞来源的外泌体递送miR21来获得,抑制基质细胞来源的miR21可能是治疗转移性或复发性卵巢癌的一个新策略。题目-Exosomal transfer of stroma-derivedmiR21 confers paclitaxel resistance in ovarian cancer cells through targetingAPAF1.
3. Extracellular vesicles carry miR-195 tointrahepatic cholangiocarcinoma and improve survival in a rat model.大鼠模型中,细胞外囊泡携带miR-195到肝内胆管癌细胞并改善疾病预后。 [Hepatology] IF=11.711 PMID:27474881 摘要:肿瘤微环境在肿瘤的发展和稳态中发挥着重要作用。这一模式说明肿瘤中的成纤维细胞可能是通过响应癌细胞刺激来支持肿瘤细胞。我们的目的在于研究肿瘤相关成纤维细胞来源的囊泡(EV)传递microRNA(miR)到肿瘤细胞。为此,我们依照目前发表的试验方法分离了EV。我们通过qRT-PCR对EVs中的miR进行了分析。我们发现EV在体外实验和体内实验中都能够将特定的miR传递给肝胆管癌细胞。我们发现,miR-195在癌细胞和周边的成纤维细胞中都有所下调,进一步我们发现成纤维细胞来源的EVs可以传递miR195到肿瘤细胞。最后,我们使用成纤维细胞来源的EVs装载miR-195在大鼠模型中处理癌细胞,miR195在癌细胞中的浓度会上升,同时肿瘤会变小,大鼠生存期会延长。由此可知, EVs可以携带miRNA在肿瘤相关成纤维细胞和癌细胞间传递,深入了解这一过程对我们开发新型疗法具有重要意义。 PS:miRNA在囊泡中的存在和功能发挥是目前研究比较多的内容。但该文章不仅探讨了miRNA在囊泡行为中的作用,同时利用囊泡装载miRNA进行了实验性的肿瘤治疗,并且在大鼠模型中取得了一定的效果。这为siRNA药物的发展提供了一定的思路。
4. Elucidating diversity of exosomes:biophysical and molecular characterization methods.阐明外泌体的多样性:生物物理学和分子生物学为基础的定性分析方法。 [Nanomedicine] IF=4.889 PMID:27488053 摘要:外泌体是细胞在正常生理或病理条件下释放到体液中的纳米囊泡。由于他们是细胞间通信的一个重要手段,越来越多的证据表明外泌体是多种疾病的重要参与者和调节者。它们在疾病诊断中具有很大的潜在应用价值,而强大的分离和定性外泌体的方法是外泌体相关试验和应用的基础。在过去的几年中,基于生物物理学或分子生物学的多种多样的定性外泌体的方法开始出现。在这篇综述中,我们总结了相关技术:1、光谱学为基础的生物物理学方法(如Raman广谱、动态光散射)和其他方法(如扫描电镜、原子力显微镜),2、以抗体为基础的分子生物学技术包括流式细胞术、透射电镜等,3、纳米技术相关的外泌体定性方法。 PS:一篇关于外泌体鉴定和分析的方法学综述,具体内容参见摘要。
5. Dynamics of microvesicle generation inB cell chronic lymphocytic leukemia: Implication in disease progression.B细胞慢性淋巴细胞白血病产生囊泡的动态分析:与疾病进展相关。 [Leukemia] IF=12.104 PMID:27480387 摘要:此前,我们报道了B细胞慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者含有更高水平的囊泡(MVs)。然而,由于CLL B细胞的休眠性和该疾病进展的相对缓慢,所以MV产生的动态过程以及它们独特的表型还不是很清楚。在本文中,我们发现,CLL B细胞可以自发产生MVs并在B细胞受体配体的诱导下释放量进一步增加。一个有趣的现象,在体内CLL B细胞主要产生CD52+的MVs,而不是体外CD19+的MVs,这暗示着在体内CLL B细胞会优先使用CD52。同时,CLL质膜来源MVs的表型与体外的发现一致。我们发现以前未经治疗的CLL患者CD52+的MVs积累增加。对治疗前后的CLL患者MVs进行分析发现,CD52+的MVs水平在治疗后显著下降,部分治疗后的患者会维持一个低水平,而多数患者在治疗后一段时间会有CD52+的MVs积累增加的趋势(25/33)。这项研究表明,CD52+的MVs在血浆中的积累可以反应CLL的进展情况,并指导临床针对性的开展治疗。 PS:一篇血浆外泌体反映B细胞慢性淋巴细胞白血病进展的biomarker文章。作者发现CD52+的MVs与疾病进展正相关。
6. Exosomes derived from tumor cellsgenetically modified to express Mycobacterium tuberculosis antigen: a novelvaccine for cancer therapy.通过基因修饰使肿瘤来源的外泌体携带结核分枝杆菌抗原:一种新型的肿瘤疫苗。 [Biotechnol Lett] IF=1.639 PMID: 27484689 摘要:为了探究利用肿瘤来源的囊泡表达结核分枝杆菌抗原制作肿瘤疫苗来改善肿瘤的低免疫原性,我们将结核分枝杆菌抗原ESAT-6转入B16黑色素瘤细胞系中。我们收集了带有肿瘤自身抗原和病原菌抗原的外泌体,当我们将外泌体注射于小鼠足垫一定时间后,他们显著地诱发了小鼠机体对ESAT-6和B16肿瘤抗原的细胞免疫反应。尽管两种外泌体所携带的肿瘤抗原基本相同,但注射携带ESAT-6肿瘤来源外泌体的小鼠荷瘤后对肿瘤的抑制效果明显强于注射常规肿瘤来源外泌体的小鼠。这些数据表明,通过肿瘤细胞来源的携带特定抗原的外泌体做成的疫苗具有克服肿瘤免疫逃逸的潜力。 PS:一篇小文章,将特定抗原表达于肿瘤来源外泌体上来增强肿瘤的免疫原性,想法不错,感觉数据不是很可靠,不知道这样的数据是否可以被重复出来,感兴趣的可以看一眼。
7. Identifying Urinary and Serum ExosomeBiomarkers for Radiation Exposure Using a Data Dependent Acquisition andSWATH-MS Combined Workflow.通过Data Dependent Acquisition和SWATH-MS联合分析来鉴定尿液和血浆中针对射线辐照的生物标志物。 [Int J Radiat Oncol Biol Phys]IF=4.495 PMID: 2748528
8. Leptin induces the generation ofprocoagulant, tissue factor bearing microparticles by human peripheral bloodmononuclear cells. 瘦素促进外周血单核细胞释放促凝血的耐受组织因子的微囊泡。[Biochim Biophys Acta] IF=5.083 PMID:27015759
多个媒体报道了纳米级侧向位移芯片,包括我们的公众号以及奇点网等,感兴趣的可以多了解一下。相信它会改变目前外泌体主要处于科学研究而很少应用的局面,越来越多的应用型的研究会涌现出来。今天的整理就到这里。希望大家可以有所收获。大家下周见!
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