ISME：海水中的包膜囊泡

广州永诺生物

1. 海水中的包膜囊泡：DNA 内含物异质性体现病毒的丰度
Membrane vesicles in sea water: heterogeneous DNA content and implications for viral abundance estimates.

期刊：ISME Journal
影响因子：9.328
作者单位：麻省理工学院

文献简介
很多细菌从它们的外表面释放膜包围的胞外囊泡(EV)进入周围微环境。在部分栖息地，包括海洋，也能发现囊泡，它们很可能在微生物生态系统中发挥着一系列的功能。EV 已知含有许多生物分子包括DNA，但是DNA 包裹进囊泡的规律尚不清楚。这篇文章中，作者检测了从5 种不同细菌分泌的囊泡的DNA 的量和分布，发现囊泡分泌的DNA 片段的双链DNA 量以及大小分布，都因类群的不同而存在差异。尽管部分含有丰富DNA 的囊泡通过SYBR 荧光DNA 染料染色后能观察到，但这种情况在囊泡中只占极少部分(<0.01-1% )。因此说，不同类的DNA 会被包裹进不同类的囊泡中；与病毒相比，囊泡可能是天然海水中SYBR 可观察颗粒中的一个微量组分。与这个猜想一致，对沿岸和近海海水样品进行氯仿处理，发现囊泡增加了少于1 个数量级的荧光显微镜下颗粒（病毒的）数，它们带来的影响在空间和时间上都是可变的。

小诺看法
在真核生物exo 的研究中，exo 的内含物表现出异质性。细菌囊泡的相关报道较少，这篇文章证明细菌囊泡里的DNA 也具有异质性，支持了EV 是由具有独特组成的不同亚群构成的观点。这篇文章中从提取囊泡的方法与提取exo 的一般方法基本一致：0.2 μm capsule Filter→100kDa Ultrasette tangential flow filter→0.2 μmsyringe filter→ ~100,000g 超离1.5h 沉淀囊泡，上Optiprep 梯度离心100,000 g 6h，电镜观察提取的exo，有兴趣进行此类样本的exo 研究的同学可以参考一下。


2. 外泌体定量技术进展
Advances in Exosome Quantification Techniques

期刊：Trends in Analytical Chemistry
影响因子：7.487
作者单位：新加坡国立大学

文献简介
这篇文章的作者归纳了具代表性样本的exo 定量技术的进展，阐述了它们的原理，对未来的挑战和展望提出了自己的看法。

小诺看法
关于定量方法的综述，应该能帮到不少同学的忙。






3. 从叶片质外体提取的胞外囊泡运载着应激反应蛋白
Extracellular vesicles isolated from the leaf apoplast carry stress-response proteins

期刊：Plant Physiology
影响因子：6.28
作者单位：美国印第安纳大学

文献简介
科学家们已经发现植物也可以产生EV，特别是在应答病原体感染的时候，但还没有研究者对植物EV 的内含物进行分析，它们的功能也尚不清楚。这篇文章的研究者叙述了一个从拟南芥叶片质外体液(apoplastic fluid)提取EV 的方法，再对EV 进行蛋白质组分析，结果发现富集了生物和非生物胁迫应答的相关蛋白。相应地，被丁香假单胞菌感染的植物、水杨酸处理后的植物的EV 分泌增强。这项发现表明EV可能是植物免疫应答的一个重要成员。

小诺看法
远在1960 年代末，就有植物EV 的报道，但从叶片提取EV 进行研究，这应该还是首次报道，光建立植物EV 标志物和囊泡定量方法，就挺不容易的，这篇文章值得一读！