做外泌体RNA的注意了！即使去除外泌体的血清也可能干扰...

土豆

做外泌体RNA的注意了！

即使去除外泌体的血清也可能干扰你细胞外泌体的RNA组成！！

胎牛血清（FBS）已在真核细胞培养中使用了几十年了。然而，很少有人关注FBS的RNA对培养的细胞会产生什么样的生物学效应。来自哈佛医学院的研究人员用RNA测序，证明了FBS含有蛋白质编码和调控的多种RNA，包括mRNA、miRNA、rRNA和snoRNA等。它们中的大多数（>70％）仍然存在于细胞外囊泡（EV）和细胞间通讯研究中常使用的长时间超速离心得到的无囊泡FBS（vesicle-depleted FBS, vdFBS）中。FBS相关的RNA会在分离细胞外膜泡RNA（exRNA）时一同被分离出来，这会对下游RNA分析造成干扰。许多进化上保守的FBS源的RNA种类会被错误地认为是人或小鼠细胞的转录本。值得注意的是，在FBS中含量丰富的一些miRNAs，如miR-122、miR-451A和miR-1246，先前已被报道为在培养细胞来源的细胞外膜泡中富含的miRNAs，这可能是胎牛血清中miRNAs造成的假象。对公开可用的exRNA数据库的分析支持FBS污染的概念。此外，FBS转录本可被培养的细胞吸收，并影响高度敏感的基因表达谱技术的结果。因此，实验设计过程中采取减少FBS源RNA干扰的预防措施是非常有必要的。

参考文献：

Wei, Z., et al. (2016). "Fetal Bovine Serum RNA Interferes with the Cell Culture derived Extracellular RNA." Sci Rep 6: 31175.

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hereissyk

我做过肠癌细胞exosomes RNA测序，1246含量的确很高。

wxz

我就是做Exosomes RNA的，看到这个好激动

正经的保洁小弟

辛苦了，真的辛苦了，大有收获

Lightguider

换言之，这个mRNA 会不会对细胞的外泌体分泌产生影响？

冷雪儿翱翔

来学习~~

土豆

Lightguider 发表于 2016-8-17 22:42
换言之，这个mRNA 会不会对细胞的外泌体分泌产生影响？

有这个可能性~

kasangzc

感谢分享 学习一下

seallin

还是做蛋白的好，没有这个担心，只要我把细胞用SILAC一标，有标记的必定是来自于细胞的~~~

xhn890

多谢。辛苦了，真的辛苦了