外泌体之家 | 细胞外膜泡领域核心平台—exosomes & microvesicles—小膜泡大作用

 找回密码
 立即注册
查看: 84777|回复: 227
打印 上一主题 下一主题

有没有 简单好用又便宜的miRNA qPCR检测方法?

  [复制链接]

374

主题

1497

帖子

7051

积分

超级版主

Rank: 8Rank: 8

积分
7051
跳转到指定楼层
楼主
发表于 2017-3-15 13:50:46 | 只看该作者 回帖奖励 |正序浏览 |阅读模式
本帖最后由 hzangs 于 2017-3-20 19:35 编辑

没有?

这个可以有!!!而且hzangs对该方法进行了测试!引物的评判一般考虑特异性和扩增效率,特异性可以通过qPCR溶解曲线的峰型得出,而扩增效率需要比较不同方法、不同引物对同一基因的扩增效果才可得出。考虑到扩增效率评定比较繁琐,所以hzangs在测试时只考察了引物的特异性问题。hzangs利用该软件设计引物10对,以抽提的细胞total RNA作为起始RNA,利用该策略进行qPCR检测。其中7对在所有样品中溶解曲线均为单峰,2对在个别样品中出现杂峰,1对在所有样品中出现杂峰。另:出现杂峰的3对引物,其中2对引物的CT值在30以上,可以认为是极低丰度miRNA。
补充两点:1、 生成的引物在 运行算法  后 产生的新文档里!!! 2、加尾后 RNA不需要纯化,直接吸取一定数量加尾反应液进行逆转录即可。
软件在此!  方法请见微信推文!  链接:https://mp.weixin.qq.com/s/JoJczBvNTG76GpXbygca8g
使用该方法发文章,记得引用原发明人的论文。
附件已隐藏,回复该贴可查看附件  
游客,如果您要查看本帖隐藏内容请回复

释疑:
推出该方法后有朋友在微信后台留言认为这就是常规的加尾法检测miRNA,用软件设计加尾法miRNA引物本身就是个错误。  hzangs首先在这里感谢这位朋友的批评和意见。不过对于技术的探讨是仁者见仁智者见智的事情。
hzangs在此解释一下该方法与传统加尾法检测miRNA的技术差别:
传统的加尾法上游引物是miRNA序列本身,下游则是通用引物。通用引物的问题在于没有特异性,传统加尾法miRNA qPCR的引物特异性完全依靠上游引物,这就导致了传统的方法特异性低,qPCR过程容易出现非特异性扩增等问题。hzangs分享的方法下游引物的3‘端引入了靶miR的几个碱基,增强了特异性。同时基于引物设计软件自带的算法选择了下游引物3'端与靶miRNA匹配的碱基数。这也是为什么该方法需要引物设计软件的原因。如果大家还有什么问题,可以在本帖留言,与hzangs就该方法进行讨论。





本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册

x
回复

使用道具 举报

0

主题

6

帖子

53

积分

注册会员

Rank: 2

积分
53
推荐
发表于 2019-5-5 16:42:44 | 只看该作者
您好,请问能分享一下您买的polyA加尾酶的货号吗
回复 支持 0 反对 2

使用道具 举报

0

主题

19

帖子

196

积分

注册会员

Rank: 2

积分
196
228#
发表于 2024-7-16 16:50:26 | 只看该作者
谢谢分享
回复

使用道具 举报

0

主题

4

帖子

46

积分

新手上路

Rank: 1

积分
46
227#
发表于 2024-3-20 16:21:23 | 只看该作者
参照方法先试试效果!
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

3

帖子

34

积分

新手上路

Rank: 1

积分
34
226#
发表于 2023-11-22 20:48:07 | 只看该作者
回复

使用道具 举报

0

主题

24

帖子

72

积分

注册会员

Rank: 2

积分
72
225#
发表于 2023-9-25 15:38:46 | 只看该作者
欢迎来到我们的上海新闻频道,这里不仅提供新闻的表面信息,还深度报道上海市内的各种社会、文化和经济动态。我们通过深入的调查、专业分析和权威观点,为您呈现上海城市的最新发展、变迁与趋势。无论您对城市生活、政治、经济、文化或社会议题感兴趣,我们都将为您提供全面、深度的报道,以便您更好地了解这座充满活力和潜力的城市。一起来深入探讨上海的点点滴滴,掌握城市脉搏,了解这个城市的独特魅力。
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

24

帖子

72

积分

注册会员

Rank: 2

积分
72
224#
发表于 2023-9-25 15:37:14 | 只看该作者
《探索视觉创意:创意专业人士的摄影社交圈》是一个充满活力的在线社区,旨在汇聚来自世界各地的摄影爱好者、专业摄影师以及视觉艺术创作者。我们的社区致力于探索和分享视觉创意的各个方面,为会员们提供了一个创造性的平台,以展示他们的摄影作品、交流创意灵感、学习摄影技巧,并深入了解摄影领域的最新趋势和新闻。
在我们的社交圈内,您将能够浏览令人惊叹的摄影作品,从中获得灵感并与其他创意专业人士建立联系。我们定期发布摄影新闻,涵盖行业内的重要事件、展览、竞赛和趋势,确保您始终保持在摄影领域的前沿。
无论您是初学者还是经验丰富的摄影师,都欢迎加入我们的社区。在这里,创意与摄影相互融合,帮助您发掘新的摄影技巧,分享您的视觉故事,并在一个充满激情和创造力的环境中建立有意义的联系。探索创意之旅,尽在《探索视觉创意》社交圈!
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

6

帖子

28

积分

新手上路

Rank: 1

积分
28
223#
发表于 2023-9-18 18:09:11 | 只看该作者
谢谢分享
回复

使用道具 举报

0

主题

1

帖子

12

积分

新手上路

Rank: 1

积分
12
222#
发表于 2022-11-9 11:41:37 | 只看该作者
感觉有用,谢谢,想试试呀
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

11

帖子

79

积分

注册会员

Rank: 2

积分
79
221#
发表于 2022-8-12 17:16:29 | 只看该作者
多谢分享,谢谢
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

2

帖子

14

积分

新手上路

Rank: 1

积分
14
220#
发表于 2022-8-9 09:30:47 | 只看该作者
感谢分享,正在关注这方面的东西呢
回复 支持 反对

使用道具 举报

关闭

站长推荐上一条 /1 下一条

QQ|Archiver|手机版|外泌体之家 | exosomes & microvesicles  

GMT+8, 2024-11-22 22:14 , Processed in 0.175443 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.3

© 2001-2017 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表