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【2016.7.8】This Week in Extracellular Vesicles

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发表于 2016-7-8 21:44:23 | 只看该作者 回帖奖励 |正序浏览 |阅读模式
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本周hzangs在最新文献中选取了5篇分享给大家,其中4篇提供了中文摘要。这周的内容主要涉及外泌体形成调控、蛋白组学对比外泌体蛋白及游离蛋白、外泌体miRNA检测新方法等。相关文章的原文都在论坛同名贴下,需要的可以到论坛下载。
1.       An ER-Associated Pathway DefinesEndosomal Architecture for Controlled Cargo Transport.一个内质网相关的信号通路决定着胞内体的物质转运过程。[Cell] IF=28.71 PMID: 27368102
摘要:通过一个逐步形成成熟囊泡的过程,胞内体系统连接着细胞内部和胞外空间的物质转运。有趣的是,这一系统具有双相架构——相对固定的核周囊泡“云”和高度动态的外围囊泡。这一架构是如何被调控的以及其发挥着怎么样的重要功能目前还并不十分清楚。本文中,我们揭示了内质网定位的泛素连接酶-环指蛋白26RNF26)在胞内体系统整体架构上发挥着重要作用。在核周囊泡区域,具有催化能力的RNF26会泛素化p62/SQSTM1复合体从而吸引各种具有泛素结合结构域的囊泡适配蛋白。因此,RNF26可以抑制囊泡向外围运输,直到去泛素化酶USP15拮抗RNF26的功能才会使囊泡向外转运。通过调节胞内体系统,RNF26影响着胞内体的成熟和物质转运。
PS:通常认为外泌体起源于细胞内的胞内体(endosome),目前对外泌体的形成及成熟研究还不是很多,该文章介绍了RNF26对胞内体成熟过程的调控,感兴趣的可以了解一下。
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2.       Proteomic Analysis of Exosomes andExosome-Free Conditioned Media Derived from Human Osteosarcoma Cell LinesReveal Differential Secretion of Proteins Related to Biological Functions andTumor Progression.蛋白质谱分析发现骨肉瘤来源的外泌体及无外泌体条件培养液携带有不同的分泌蛋白参与不同的生物学功能和肿瘤进程。 [J Cell Biochem] IF=3.446  PMID27356893
摘要:骨肉瘤是儿童时期高发的一种恶性骨肿瘤。目前,只有少量的文献报道过对骨肉瘤分泌组学的研究。我们为了研究骨肉瘤的分泌蛋白组,对3中人源骨肉瘤细胞系的条件培养液进行了分析。我们分析了条件培养液中外泌体和剩余组分包涵的分泌蛋白。首先,我们使用透射电镜和免疫印迹鉴定了外泌体,之后利用气相色谱-质谱分析分别对外泌体携带的和条件培养基剩余组分中溶解的蛋白进行了鉴定。通过GO分析这些分泌蛋白进行了分类。我们共确定了3300种蛋白。这些骨肉瘤细胞系的分泌组具有一部分共有蛋白,同时每个细胞系都有特殊的分泌蛋白。系统的分析外泌体所携带的蛋白以及条件培养液剩余部分所携带的可溶性蛋白发现它们富集在不同的生物学功能通路中。这一数据表明骨肉瘤分泌组对肿瘤进展起着重要作用。
PS:一篇介绍肿瘤细胞分泌组的小文章,文章特色在于他们分别分析了条件培养液中外泌体及剩余组分所具有的蛋白质成分,并且对比了两部分蛋白的异同,这是目前还不多见的研究。虽然文章影响因子不高,但是具有一定的借鉴意义。
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3.       Simultaneous and multiplexed detectionof exosome microRNAs using molecular beacons.利用分子信标同时检测外泌体中多种miRNA[Biosens Bioelectron] IF=7.476. PMID:27372573
摘要:在外泌体中同时检测多个miRNA的水平可以作为一种用于多种疾病诊断的高效的诊断策略。由于外泌体处于循环系统中,因此外泌体生物标志物检测相比传统检测方法具有多方面优势。一般来说,基于PCR的方法可以检测外泌体中的miRNA,但是这些方法工作量大、成本高、费时长,这使得基于PCR的方法不适用于高通量的疾病诊断。之前我们报道了通过使用寡链核苷酸探针或分子信标检测外泌体中单个miRNA。本文中,我们展示了利用分子信标同时检测多个miRNA靶分子的技术。我们选取了具有释放miR-21miR-375miR-27a高含量外泌体的MCF-7细胞系作为外泌体来源细胞系,即使这些miRNA在血清中也具有较高浓度,分子信标依旧成功杂交并检测到外泌体中的多个不同miRNA。得注意的是,由于外泌体体积比较小,所以在同时检测多中miRNA时荧光基团的选择尤为重要。在这篇文章中所描述的方法有利于高通量诊断和分析疾病,判断预后和治疗反应。
PS:外泌体中RNA作为生物标志物是目前多数临床研究的目标,而传统基于PCR的检测方法比较费时费力,该文介绍了一种基于分子探针的检测外泌体中miRNA的方法,也许在未来的应用中会比较有优势。
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4.       AHNAK enables mammary carcinoma cells to produce extracellular vesicles that increase neighboringfibroblast cell motility.AHNAK可以使乳腺癌细胞来源的细胞外囊泡提升癌细胞周边成纤维细胞的运动能力 [oncotarget] IF=5.008.PMID: 27374178
摘要:细胞外囊泡在肿瘤的发展中起着重要的作用。它们包括微囊泡和外泌体等亚组分。然而,这些细胞外囊泡影响肿瘤进展的机制目前并不十分清楚。本文中,我们研究了乳腺癌细胞与邻近的乳腺成纤维细胞之间的囊泡通讯。无偏差蛋白质组学分析显示细胞蛋白质组的1%的蛋白质出现在囊泡中,AHNAKannexin A2是含量最多的两种蛋白质。尤其,AHNAK是含量最多并且是囊泡形成所必须的。此外,我们发现癌细胞产生的囊泡可以促进成纤维细胞的迁移。这些数据提示我们AHNAK能够是乳腺癌细胞产生并释放细胞外囊泡,这些囊泡可以通过周围的成纤维细胞破坏肿瘤组织基质。
PS:一篇外泌体携带蛋白对肿瘤微环境的影响,感兴趣的可以读读。
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5.       Biogenesis of a new type ofextracellular vesicles in gastrointestinal stromal tumors: ultrastructuralprofiles of spheresomes.在肠胃肿瘤中一种新型细胞外囊泡的形成:超微结构解析球状囊泡(spheresome)。[Histochem Cell Biol] IF=2.78. PMID:27373548
PS:一篇介绍一种可能的新型囊泡的小文章,关注的可以了解一下。
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今天的整理就到这里。希望大家可以有所收获。大家下周见!

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