外泌体之家 | 细胞外膜泡领域核心平台—exosomes & microvesicles—小膜泡大作用

 找回密码
 立即注册
查看: 84778|回复: 227
打印 上一主题 下一主题

有没有 简单好用又便宜的miRNA qPCR检测方法?

  [复制链接]

374

主题

1497

帖子

7051

积分

超级版主

Rank: 8Rank: 8

积分
7051
跳转到指定楼层
楼主
发表于 2017-3-15 13:50:46 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 hzangs 于 2017-3-20 19:35 编辑

没有?

这个可以有!!!而且hzangs对该方法进行了测试!引物的评判一般考虑特异性和扩增效率,特异性可以通过qPCR溶解曲线的峰型得出,而扩增效率需要比较不同方法、不同引物对同一基因的扩增效果才可得出。考虑到扩增效率评定比较繁琐,所以hzangs在测试时只考察了引物的特异性问题。hzangs利用该软件设计引物10对,以抽提的细胞total RNA作为起始RNA,利用该策略进行qPCR检测。其中7对在所有样品中溶解曲线均为单峰,2对在个别样品中出现杂峰,1对在所有样品中出现杂峰。另:出现杂峰的3对引物,其中2对引物的CT值在30以上,可以认为是极低丰度miRNA。
补充两点:1、 生成的引物在 运行算法  后 产生的新文档里!!! 2、加尾后 RNA不需要纯化,直接吸取一定数量加尾反应液进行逆转录即可。
软件在此!  方法请见微信推文!  链接:https://mp.weixin.qq.com/s/JoJczBvNTG76GpXbygca8g
使用该方法发文章,记得引用原发明人的论文。
附件已隐藏,回复该贴可查看附件  
游客,如果您要查看本帖隐藏内容请回复

释疑:
推出该方法后有朋友在微信后台留言认为这就是常规的加尾法检测miRNA,用软件设计加尾法miRNA引物本身就是个错误。  hzangs首先在这里感谢这位朋友的批评和意见。不过对于技术的探讨是仁者见仁智者见智的事情。
hzangs在此解释一下该方法与传统加尾法检测miRNA的技术差别:
传统的加尾法上游引物是miRNA序列本身,下游则是通用引物。通用引物的问题在于没有特异性,传统加尾法miRNA qPCR的引物特异性完全依靠上游引物,这就导致了传统的方法特异性低,qPCR过程容易出现非特异性扩增等问题。hzangs分享的方法下游引物的3‘端引入了靶miR的几个碱基,增强了特异性。同时基于引物设计软件自带的算法选择了下游引物3'端与靶miRNA匹配的碱基数。这也是为什么该方法需要引物设计软件的原因。如果大家还有什么问题,可以在本帖留言,与hzangs就该方法进行讨论。





本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有帐号?立即注册

x
回复

使用道具 举报

0

主题

6

帖子

53

积分

注册会员

Rank: 2

积分
53
推荐
发表于 2019-5-5 16:42:44 | 只看该作者
您好,请问能分享一下您买的polyA加尾酶的货号吗
回复 支持 0 反对 2

使用道具 举报

1

主题

11

帖子

94

积分

注册会员

Rank: 2

积分
94
沙发
发表于 2017-3-15 15:07:50 | 只看该作者
厉害了.刚刚还在考虑怎么做miRNA
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

8

帖子

50

积分

注册会员

Rank: 2

积分
50
板凳
发表于 2017-3-15 15:36:54 | 只看该作者
回复

使用道具 举报

0

主题

1

帖子

14

积分

新手上路

Rank: 1

积分
14
地板
发表于 2017-3-15 15:37:49 | 只看该作者
谢谢楼主分享
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

4

帖子

22

积分

新手上路

Rank: 1

积分
22
5#
发表于 2017-3-15 15:54:43 | 只看该作者
厉害,谢谢楼主分享,刚好做引物
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

3

帖子

20

积分

新手上路

Rank: 1

积分
20
6#
发表于 2017-3-15 15:55:16 | 只看该作者
方便快捷高效
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

4

帖子

22

积分

新手上路

Rank: 1

积分
22
7#
发表于 2017-3-15 15:55:48 | 只看该作者
厉害了楼主,解决了现在的当务之急
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

4

帖子

22

积分

新手上路

Rank: 1

积分
22
8#
发表于 2017-3-15 16:09:22 | 只看该作者
用了之后怎么闪退啊。。。。
回复 支持 反对

使用道具 举报

374

主题

1497

帖子

7051

积分

超级版主

Rank: 8Rank: 8

积分
7051
9#
 楼主| 发表于 2017-3-15 16:46:25 | 只看该作者
红桃k 发表于 2017-3-15 16:09
用了之后怎么闪退啊。。。。

看来没有好好读推文哦,好好研究一下推文    引物在运行算法之后产生的新文档里。
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

1

帖子

14

积分

新手上路

Rank: 1

积分
14
10#
发表于 2017-3-15 16:49:28 | 只看该作者
谢谢楼主分享!!!
回复 支持 反对

使用道具 举报

关闭

站长推荐上一条 /1 下一条

QQ|Archiver|手机版|外泌体之家 | exosomes & microvesicles  

GMT+8, 2024-11-22 22:18 , Processed in 0.233666 second(s), 26 queries .

Powered by Discuz! X3.3

© 2001-2017 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表