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【2018.3.2】This Week in Extracellular Vesicles

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发表于 2018-3-4 16:01:01 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式


本周hzangs在最新文献中选取了12篇分享给大家,其中 8篇提供中文摘要。第1篇介绍了hnRNPQ在miRNA分选进入外泌体过程中参与miRNA序列识别过程,不久前刚刚介绍过类似的一篇,相信RNA分选进入囊泡的机制会有越来越多的报道;第2篇介绍了利用单分子荧光显微镜用于动态观测记录外泌体和外泌体内容物进入受体细胞后的后续命运的方法报道;第3篇报道了一个miRNA通过靶向外泌体形成释放相关蛋白来正反馈调节自身丰度,这里暗示我们可能存在一大类这样的分子,感兴趣的朋友赶快行动起来;第4篇是一个临床研究报道,介绍了循环系统中外泌体携带的长链非编码RNA——HOTTIP在胃癌病人诊断和预后判断中的潜在实用意义。其余各文章也各有新意,感兴趣的可以各取所需。相关文章的原文在周一前会发布到论坛同名贴下,需要的可以到论坛下载


1.   A cryptic RNA-binding domain mediatesSyncrip recognition and exosomal partitioning of miRNA targets.  Syncrip 蛋白隐蔽的RNA结合结构域介导了miRNA靶标的识别和外泌体分选。 [Nat Commun] IF=12.12  PMID:29483512

摘要:外泌体miRNA转移是细胞间通讯的一种机制,其在免疫应答,神经系统功能和癌症中是十分重要的。 Syncrip / hnRNPQ是一种高度保守的RNA结合蛋白,介导一组miRNA的外泌体分选。在这里,我们报道了Syncrip的氨基末端结构域(以前被认为介导蛋白质 - 蛋白质相互作用)是一个神秘的,保守的和序列特异性的RNA结合结构域,我们将其命名为NURR(用于RNA识别的N末端单位)。 NURR结构域介导了Syncrip外泌体miRNA靶标的短hEXO序列的特异性识别,同时通过非经典结构元件与Syncrip的RRM结构域结合以实现高亲和性miRNA结合。因此,Syncrip介导的靶miRNA选择意味着通过NURR结构域识别hEXO序列,并且RRM结构域5'与该序列结合。这种结构安排使Syncrip能够介导选择具有特定序列的miRNA。

PS:这已经是nature communication近期发表的第二篇关于外泌体中RNA分选的报道了。该文章介绍了hnRNPQ对特定miRNA分选进入外泌体的分选作用。外泌体miRNA的分选是目前相对研究比较少的方面,感兴趣的朋友可以关注一下。

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2.    Visualization and intracellular dynamic tracking of exosomes and exosomal miRNAs using single molecule localization microscopy.  使用单分子定位显微镜对外泌体和外泌体miRNA进行可视化的细胞内动态追踪。 [Nanoscale] IF=7.37  PMID:29492481

摘要:外泌体是由各种细胞分泌的具膜囊泡。研究表明外泌体miRNA可以影响受体细胞的生物学过程。因此,在外泌体功能分析中,受体细胞中外泌体miRNA的直接成像和追踪技术对于未来的研究是必不可少的。然而,受传统荧光显微镜的分辨率限制,传统荧光显微镜无法对外泌体大小的结构(<100nm)进行精确成像和跟踪。在这里,我们利用单分子定位显微镜(SMLM)来实现活细胞中外泌体和外泌体miRNA的可视化动态追踪。首先,我们展示了来自HeLa的外泌体和两种外泌体miRNA(mir-21和mir-31)的同时SMLM成像,并追踪它们在细胞摄取后的运动。我们成功观察到外泌体在细胞丝状结构内的运动。此外,基于双色SMLM的动态追踪显示,作为细胞货物的一种天然载体,外泌体可以将mir-21封装在内部以防止酶在转移过程中对其的降解作用,之后miRNA会从外泌体释放到受体细胞中。这些发现可以为细胞间通讯的途径提供新的见解,并证明SMLM是一种用于跟踪受体细胞中外泌体和外泌体内容物运动的强大技术。

PS:外泌体内容物进入受体细胞后会经过什么样的过程,这是一个目前还不是很清楚的问题。受制于一些研究技术的限制,这个问题的解决需要不断的利用各种技术来慢慢研究。这里这篇东南大学老师们发表的文章介绍了利用单分子荧光显微镜对被摄取后外泌体和外泌体内容物的行为进行了研究。这证实了该系统在外泌体内容物被摄取后的过程研究中具有实用意义。

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3.   miR-34c-5p promotes eradication ofacute myeloid leukemia stem cells by inducing senescence through selective RAB27B targeting to inhibit exosome shedding.   miR-34c-5p通过选择性靶向RAB27B抑制外泌体脱落来促进根除急性髓性白血病干细胞。 [Leukemia ] IF=11.70  PMID:29479064

摘要:白血病干细胞(LSCs)直接参与急性髓细胞白血病(AML)化疗耐药和复发。在这里,我们发现与正常造血干细胞(HSC)相比,AML(非急性早幼粒细胞白血病,非APL)干细胞中miR-34c-5p(衰老调节网络的中心miRNA)显着下调。 LSC中miR-34c-5p的低表达与AML患者的不良预后和不良反应密切相关。增加miR-34c-5p表达你能够诱导LSCs在体外衰老,阻止白血病的发展并促进LSCs在免疫缺陷小鼠中的根除。机制方面,过表达miR-34c-5p能够通过p53-p21Cip1-细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)/细胞周期蛋白或p53非依赖性CDK /细胞周期蛋白途径诱导LSC中的衰老。外泌体介导的miR-34c-5p转移是LSC中miR-34c-5p缺陷的原因之一。此外,miR-34c-5p可以通过靶向RAB27B(一种促进外泌体脱落的分子)抑制外泌体从母细胞脱落来正反馈调节自身表达水平。总体而言,本研究报道了通过在LSCs增加miR-34c-5p表达来重新启动衰老来建立治疗AML患者的新策略。这种miRNA介导的肿瘤干细胞衰老也可能在其他恶性肿瘤中具有重要的治疗价值。

PS:文章报道了miR-34c-5p在抑制白血病干细胞方面的作用,其中发现了miR-34c-5p靶向RAB27B抑制外泌体从母细胞脱落从而正反馈调节自身水平这一过程。这一过程在其他的系统中可能同样存在。这也暗示我们一些靶向外泌体形成过程相关分子的miRNA可能存在这样的正反馈调节过程。

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4.  Exosomal long noncoding RNA HOTTIP as potential novel diagnostic and prognostic biomarker test for gastric cancer.  外泌体中长链非编码RNA HOTTIP作为潜在的胃癌诊断和预后生物标志物。[Mol Cancer] IF=6.20  PMID:29486794

摘要:长链非编码RNA HOTTIP在人类癌症的发生和发展中起着重要作用。外泌体通过在细胞间传递分子而参与细胞通信,并被视为非侵入性诊断的生物标志物载体。然而,对循环外泌体中存在HOTTIP和外泌体HOTTIP在胃癌(GC)中的潜在作用知之甚少。本研究旨在研究外泌体HOTTIP在胃癌中的临床作用。通过逆转录实时定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测246名受试者(126名GC患者和120名健康人)的血清外泌体HOTTIP。我们的结果显示,外泌体HOTTIP的表达水平通常在GC患者中比正常对照中表达高(P <0.001)。其表达水平与侵袭深度(P = 0.0298)和TNM分期(P <0.001)显着相关。外泌体HOTTIP的AUC为0.827,其显示出比CEA,CA 19-9和CA72-4更高的诊断能力(AUC分别为0.653,0.685和0.639)(P <0.001)。 Kaplan-Meier分析显示高水平的外泌体HOTTIP与不良总生存率(OS)之间存在相关性(logrank P <0.001)。单因素和多因素COX分析显示外泌体HOTTIP过表达是GC患者的独立预后因素(P = 0.027)。这些发现表明外泌体HOTTIP可能是GC诊断和预后的潜在生物标志物。

PS:山东大学老师们的最新研究报道。文章介绍了循环系统中外泌体携带的HOTTIP作为胃癌诊断和预后判断标志物的潜在可能性。研究结果表明外泌体HOTTIP在胃癌患者的表达水平明显高于正常对照,是一个良好的潜在标志物。一篇很不错的临床研究文章,医学生朋友们可以学习借鉴一下。

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5.  Engineering Extracellular Vesicles with the Tools of Enzyme Prodrug Therapy.  工程改造的细胞外囊泡作为酶前体药物疗法的工具。 [Adv Mater] IF=19.79  PMID:29473230

摘要:细胞外囊泡(EVs)作为细胞间通讯的重要介质,潜在的药物载体和疾病生物标志物近来已经获得了广泛的关注。目前认为这些源自天然细胞的纳米颗粒是生物相容的,在生理条件下稳定,并且与其他合成纳米颗粒相比显示出更低的免疫原性。虽然临床试验刚刚开始进行,但由于不可控的脱靶活性和可能影响它们到达靶组织能力的系统给药方式所带来的潜在“稀释效应”,EVs用于治疗应用可能会受到限制。为了充分发挥其治疗潜力,细胞外囊泡被嵌入到植入式生物材料中,旨在利用酶前体药物疗法(EPT)实现局部治疗的药物递送。在用于EPT方法的EV首次应用中,EV被用作智能载体,用于稳定水凝胶中的酶,用于局部控制良性药物前提向活性抗炎化合物的转化。结果表明,自然来源的细胞外囊泡的抗炎潜力与合成载体相当或更好,特别是在反复长期孵育和存在炎症相关巨噬细胞的模型。此外,本文介绍了水凝胶中EVs的密度依赖性彩色扫描电子显微镜成像,这是在生物环境中进一步理解EV的有效工具。

PS:细胞胞外囊泡作为人工改造的功能载具的报道,文章介绍了利用细胞外囊泡包裹和递送特定的药物用于治疗目的的尝试。

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6.   Exosomes in Pathogen Infections: A Bridge to Deliver Molecules and Link Functions.  外泌体与病原体感染:传递分子的载具-连接宿主的桥梁。 [Front Immunol] IF=6.43  PMID:29483904

摘要:外泌体是来源于细胞内吞作用的细胞外囊泡,其作为细胞之间的递质。它们由蛋白质,脂质和RNA组成,它们可以参与细胞间的交互通讯。因此,它们在健康和疾病中发挥着重要作用。我们的观点是外泌体通过传递其内容而对病原体感染产生双向调节作用。首先,含有来自病原体的蛋白质和RNA的外泌体可通过三种方式促进感染:(1)通过传递病原体相关分子来介导进一步的感染; (2)参与病原体的免疫逃逸;(3)通过有利于免疫细胞凋亡来抑制免疫应答。其次,外泌体通过以下途径发挥抗感染作用:(1)直接抑制病原体的增殖和感染; (2)诱导免疫应答,例如与单核 - 巨噬细胞,NK细胞,T细胞和B细胞的功能有关的免疫应答。我们相信外泌体通过上述机制在病原体感染过程中充当“桥梁”。本综述描述了目前关于外泌体和病原体感染的研究发现,并强调其在临床诊断和治疗中的巨大潜力。我们讨论两个相反的方面:感染和抗感染。同时,我们详细阐述了外泌体在免疫调节中的作用。

PS:囊泡在病原体侵染宿主过程中发挥了一定的功能,同时也有文章报道囊泡在宿主抵御病原体侵染过程中也发挥了部分功能。这篇综述文章则从两个方面对目前的研究进展进行了汇总和介绍。

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7.  Exchange of genetic material: a new paradigm in bone cell communications.  遗传物质的交换:骨中细胞通讯的新范例。 [Cell Mol Life Sci] IF=5.79  PMID:29487950

摘要:哺乳动物细胞间通讯的一种新近发现的方式是通过交换遗传物质来介导,主要以RNA的形式进行。在这篇综述中,我们对以骨细胞通讯为重点的遗传物质转运进行了讨论。讨论乐三种主要的通讯载体:间隙连接,蛋白质结合复合物和胞外囊泡介导的遗传物质交换。尽管蛋白质水平的交换已被充分证明,但是没有综述总结通过骨组织中的遗传信息交换以及其在骨稳态和骨相关疾病方面的生物功能。本综述的目的是促进这一有关骨细胞通讯的相关发现的进一步理解,并为进一步研究提供参考。

PS:一篇综述文章,在骨微环境中细胞外囊泡的研究相对较少,这篇总结骨细胞间通讯的综述里汇总了细胞外囊泡在骨微环境中发挥通讯功能的相关报道,感兴趣的可以读读。

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8.   Characterization of extracellular vesicles derived from cardiac cells in an in vitro model of preconditioning  .在体外预处理模型中表征源自心脏细胞的细胞外囊泡。 [J Extracell Vesicles ]    PMID:29479396

摘要:预处理是保护心脏免受缺血 - 再灌注损伤的有前景的技术。在这种情况下,不同心脏细胞类型之间的相互影响,特别是心脏保护介质的交换已成为当前研究的焦点。最近细胞外囊泡(EVs)和纳米级结构被认为可能是潜在额通讯介质。它们被受体细胞摄取并可改变基因表达或激活细胞内信号级联反应。目前的研究已经揭示所有心脏细胞类型都能够分泌EVs,但迄今尚未研究体外预处理刺激对EV浓度和组成的影响。因此,我们使用两种已知的体外预处理刺激(缺氧或异氟烷)处理来自新生大鼠的原代心肌细胞和成纤维细胞以及H9c2细胞。在刺激48小时后通过差速离心和尺寸排阻色谱从细胞培养物上清液分离EV。它们通过透射电子显微镜,可调电阻脉冲传感,miRNA阵列和蛋白质印迹分析进行表征。检测到的EV具有典型的杯形形态和约150nm的尺寸。在不同组之间观察到EV浓度没有显着差异。用异氟烷或缺氧进行体外预处理可以影响蛋白质和miRNA的组成。如Alix,CD63,flotillin-1和热休克蛋白70这些EV标记物在被处理后显着上调。几种miRNA如miR-92b-3p,miR-761和miR-101a-5p也受到显着影响。迁移测定证实了这些EV的生理益处。总之,我们的研究结果表明,心脏细胞体外预处理模型不影响细胞外囊泡的浓度,但强烈调节细胞外囊泡的内容物并影响靶细胞迁移。这可能表明在异氟醚和缺氧诱导的体外预处理中EV介导的通讯的作用。

PS:JEV发表的研究性论文。最近JEV的发文速度明显在提升,同时发文的质量也确实不如过去了。这些可能是由于JEV需要一定量的稿件来冲进SCI,等它有了IF估计会是一个不错的细胞外囊泡领域的期刊。这篇报道介绍了体外预处理对心脏细胞释放外泌体内容物和功能的影响。

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9.   Plasma exosomes induced by remoteischaemic preconditioning attenuate myocardial ischaemia/reperfusion injury by transferring miR-24.远程缺血预处理诱导的血浆外泌体通过转移miR-24减弱心肌缺血/再灌注损伤。 [Cell Death Dis] IF=5.96  PMID:29476052

PS:经典的外泌体miRNA研究报道。发表在cell death disease上,是一篇值得学习思路和借鉴思路的文章。

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10.     Anti-HER2 scFv-directed extracellular vesicle-mediated mRNA-based gene delivery inhibits growth of HER2-positive human breast tumor xenografts by prodrug activation.  抗HER2 scFv介导的胞外囊泡基于mRNA的基因递送过程通过激活前体药物来抑制HER2阳性人乳腺肿瘤异种移植物的生长。 [Mol Cancer Ther] IF=5.76  PMID:29483213

PS:这是一篇利用细胞外囊泡作为基因治疗载具的文章,介绍了利用细胞外囊泡来传递激活药物需要的mRNA,在特定位置用于激活药物从而用于治疗。

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11. Active Probes for Imaging Membrane Dynamics of Live Cells with High Spatial and Temporal Resolution over Extended Time Scales and Areas.具有高时空分辨率和可扩展时间尺度及区域的活体探针研究活体细胞的膜动力学成像。 [J Am Chem Soc] IF=13.86  PMID:29481071

PS:材料相关的报道,文章介绍了一种探针,这种探针可以用于活细胞的膜动力学成像。该探针技术可能对未来外泌体的形成及被受体细胞摄取有的命运决定具有实用意义。

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12. Mutant p53 cancers reprogram macrophages to tumor supporting macrophages via exosomal miR-1246. p53突变型肿瘤通过外泌体中miR-1246将巨噬细胞重编程为支持肿瘤生长的肿瘤相关巨噬细胞。 [Nat Commun] IF=12.12  PMID:29472616

PS:文章在本周的推送中已经介绍过,这里仅做提示,不再赘述。

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