Tranwell小室在外泌体功能研究中的初步应用

hereissyk

做测序居然要750ml上清。。。楼主写得好详细，十分赞！

niceman1987

谢谢楼主提供的经验，可以让我少走很多弯路，希望多交流。

落叶知秋

hereissyk 发表于 2015-5-19 15:22
做测序居然要750ml上清。。。楼主写得好详细，十分赞！

这个没有参考价值，细胞不同，分泌数量变化较大，只是说，相比平时实验，测序需要外泌体量较多！

hereissyk

落叶知秋 发表于 2015-5-19 17:10
这个没有参考价值，细胞不同，分泌数量变化较大，只是说，相比平时实验，测序需要外泌体量较多！ ...

我刚拿了200ml细胞上清去测，不知道够不够，大肠癌细胞的。

落叶知秋

hereissyk 发表于 2015-5-19 21:17
我刚拿了200ml细胞上清去测，不知道够不够，大肠癌细胞的。

希望有个好结果啊！

hzangs

个人感觉  miRNA的通路预测相对简单，这个可以不考虑。
请问楼主，你的测序结果验证率怎么样？ 单个miRNA 的reads数高不高？ 测序数据量多大？ 谢谢~

wanghx_85

好帖！！！！赞赞赞赞赞！！！！！Marker备用！谢谢楼主的无私分享！

hereissyk

落叶知秋 发表于 2015-5-19 22:16
希望有个好结果啊！

200不够，看来也要再送！另外想知道你们那能买到去exosome的血清吗？

vera

好贴，MAKER备用。

wgz19841005

在这个血清的选择上，还是比较纠结的，因为用无血清培养基会激活细胞的自噬，不知道楼主有没有考虑到自噬对外泌体分泌的影响，通常来讲，自噬的增加，由于会吞噬掉细胞内的内体系统，会减少细胞的外泌体的形成和分泌，并且有文献报道了在各种不同应激状态下外泌体的内含物差异，饥饿也是一种应激，个人觉得，有条件的话，用去除外泌体的培养基或者干脆用超速离心去掉血清的外泌体好了！