本周hzangs在最新文献中选取了 篇分享给大家,其中 篇提供中文摘要。Thery大妈在与比利时一票人的合作下建立了一个在线知识库,方便大家学习相关技术,具体请了解第一篇介绍。相关文章的原文都在论坛同名贴下,需要的可以到论坛下载。 1. EV-TRACK: transparent reporting and centralizing knowledge in extracellular vesicleresearch.EV-追踪:透明易懂的细胞外囊泡研究报告汇总在线知识库。 [Nat Methods ] IF=25.328 PMID:28245209 摘要:我们认为细胞外囊泡领域需要更为透明易懂的报告来促进人们对这一领域实验的理解和重复。基于这一点,我们建立了EV-TRACK,一个众包知识(http://evtrack.org),其中集中了细胞外囊泡研究的试验方法和生物学方法。我们建立这一知识库的目的在于促进和方便文章作者、评审人员、编辑和资助者实践细胞外囊泡相关的实验。 PS:比利时的一票人拉着他们国家的thery大妈建立了这个知识库,hzangs初步看了一下,里面东西还是蛮多的,新手可以在这个网站了解不少东西。thery大妈为了囊泡领域的发展真是操碎了心,不愧是一个真正的科学家,一方面在这个领域冒进的时候及时指出领域依旧存在的重大基础问题,另一方面又在不遗余力的推进细胞外囊泡领域实验技术的普及推广。值得尊敬的大妈,哈哈。 2. Integrating liquid biopsies into themanagement of cancer.整合液体活检用于癌症的管理治疗。 [Nat Rev Clin Oncol] IF=18.786 PMID:28252003 摘要:在肿瘤的发生发展和治疗期间,肿瘤组织中的多个亚克隆群体彼此竞争,人为选择压力最终导致主要的亚克隆出现,这个亚克隆具有最强的复制和传播能力并且对治疗最不敏感。目前,研究者通过外科手术和组织活检建立了实体瘤的分子生物学特征。然而,由于基于组织的肿瘤采样偏差使得我们得到的分子生物学特征仅仅是真实情况的掠影,并且重复性差。目前的研究已经表明,循环系统中的游离肿瘤DNA(ctDNA)基因组图谱与其对应的肿瘤基因组具有高度匹配性,对肿瘤分子病理学和临床肿瘤学研究治疗具有重要的意义。ctDNA(通常称之为:液体活检)目前在临床应用中可以用于监测治疗的反应,评估耐药性的出现以及指导降低治疗副作用。除血液之外,其他体液诸如尿液、唾液、胸腔积液和脑脊液等都可能包涵肿瘤衍生的遗传信息。从循环核酸的分析(通常称为“液体活检”)可用于监测对治疗的反应,评估耐药性的出现以及量化最小的残留疾病。除了血液,几种其他体液,例如尿,唾液,胸腔积液和脑脊液,可以包含肿瘤衍生的遗传信息。ctDNA收集到的分子图谱可以进一步与循环肿瘤细胞(CTC)、囊泡内容物分析得到的图谱有机互补。在这篇综述中,我们探讨了如何利用不同形式的液体活检来知道病人护理,并最终如何整体应用到临床实践中,这篇综述我们主要探讨目前最贴近临床应用的ctDNA液体活检。 PS:nature旗下子刊发表了一篇关于液体活检在癌症治疗方面的应用和前景的综述性文章,设计囊泡领域的探讨不多,但是也从事囊泡生物标志物研究的朋友们还是值得读一读的,了解一下液体活检目前综合发展动向。 3. Label-free Proteomic Analysis ofExosomes Derived from Inducible Hepatitis B Virus-Replicating HepAD38 CellLine.非标记定量蛋白质组学分析HBV诱导型细胞系HepAD38来源的外泌体蛋白质。 [Mol Cell Proteomics ] IF=5.912 PMID:28242843 PS:非标记定量分析外泌体蛋白质组,文章使用了经典的差速超速离心法分离外泌体。感兴趣的可以了解一下。 4. Quantitative proteomics of the tobaccopollen tube secretome identifies novel pollen tube guidance proteinsimportant for fertilization.定量蛋白质组学研究烟草花粉管分泌组发现新的对受精过程发挥重要作用的花粉管引导相关蛋白。 [Genome Biol ] IF=11.313 PMID:27139692 PS:这篇文章与我们之前了解的领域不大一样,这篇文章主要涉及植物受精过程,其中发现花粉管的标志性分泌蛋白与外泌体相关蛋白同源,并认为外泌体在花粉管介导的植物受精过程中发挥着一定的作用。 hzangs建立了qq实名交流群,感兴趣的来哦~ 欢迎大家来这里聊聊天,交流交流课题。同时也可以试着解决个人问题
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