請問exosome進行NGS測序，如何避免ribosome contamination？

memorywind

想請問關於收exosome進行NGS測序的問題，最近利用兩種方式收集exosome：SIGMA的kit和超高速離心，可是送去NGS測序前的QC都沒過，說是ribosome contamination．爬帖看到有人也是一樣有這問題，而且看到有人分享說蛋白組分析的data顯示exosome會有ribosome的存在，且部分測序結果確實有ribosome序列．想請問是不是有人可以分享，如何避免ribosome contamination，或是降低ribosome contamination？謝謝．

memorywind

张宏道 发表于 2017-4-28 16:00
你是做small RNA seq？

不只small RNA seq，我打算要看microRNA和lncRNA，可是用bioanalyzer(針對small RNA)和caliper(針對total RNA)進行QC，皆顯示ribosome contamination (測到18S和28S的peak)，所以對方請我們重新收集樣品再進行QC和NGS。