請問exosome進行NGS測序，如何避免ribosome contamination？

张宏道

你是做small RNA seq？

张宏道

memorywind 发表于 2017-4-28 16:30
不只small RNA seq，我打算要看microRNA和lncRNA，可是用bioanalyzer(針對small RNA)和caliper(針對total ...

最近一篇文章提到细胞分泌的外泌体，如果使用密度梯度离心的方法，可以提取到两大类差别很大的囊泡。一类中主要是较小片段的RNA，另一类里面则包含丰富的28s和18s RNA。所以，如果你想测序的话，建议提取方法上面可以做些改变。或者去除rRNA吧。

张宏道

Peter_chen 发表于 2017-5-19 09:22
能否告知下是哪篇文献提及到这个现象呢，十分感谢

Two distinct extracellular RNA signatures released by a single cell type identified by microarray and next-generation sequencing
大牛Jan Lotvall发表的文章。