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【2017.07.23】This Week in Extracellular Vesicles

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发表于 2017-7-23 21:39:04 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本周hzangs在最新文献中选取了17篇分享给大家,7 篇提供中文摘要,其中有10篇是pubmed收录的J Extracell Vesicles杂志的文章,虽然它还没有影响因子,但该杂志发表的文章还是很有深度的,建议大家关注。相关文章的原文都在论坛同名贴下,需要的可以到论坛下载。
1.       Exosome RNA Unshielding Couples Stromal Activation toPattern Recognition Receptor Signaling in Cancer.外泌体携带非屏蔽性RNA激活肿瘤基质中特定的模式识别受体。 [Cell] IF=28.71  PMID28709002
摘要:基质成纤维细胞与癌细胞之间的相互作用对癌症产生和进展,抗药性和炎症反应有重要作用。尽管作为模式识别受体(PRR)的损伤相关分子模式(DAMP)的内源性RNA代了表一种这样的信号,这些RNA在非病理状况下则保持不被识别的状态。我们研究表明,通过乳腺癌细胞触发基质NOTCH-MYC导致POL3驱动的RN7SL1(通常被RNA结合蛋白SRP9 / 14屏蔽的内源性RNA)增加。 RN7SL1的这种增加改变了SRP9 / 14的化学计量,并在基质外泌体中产生非屏蔽性的RN7SL1。在外泌体被免疫细胞摄取后,非屏蔽的RN7SL1驱动炎症反应。被乳腺癌细胞摄取后,非屏蔽RN7SL1激活PRR RIG-1以增强肿瘤生长,转移和药物抗性。这些结果在来自患者肿瘤和血液样本中得到验证。
PS:哺乳动物细胞具有模式识别受体,这些受体通常识别诸如LPS和自体RNA等特定的相关免疫或损伤分子模式,这篇文章介绍的是外泌体所携带的一些特定作为损伤相关分子模式的内源性RNA促进肿瘤的发生发展。
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2.       Unshielding Exosomal RNA Unleashes Tumor Growth AndMetastasis.非屏蔽性RNA的释放会促进肿瘤的生长和转移。 [Cell] IF=28.71  PMID28708994
PS:这是第1篇文章的一篇评论。
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3.       Macrophage exosomes as natural nanocarriers forprotein delivery to inflamed brain.巨噬细胞来源的外泌体作为自然的纳米蛋白载体用于递送相关蛋白到发炎的大脑。 [Biomaterials] IF=8.39  PMID28715655
摘要:最近的研究发现激发了将外泌体用作纳米载体用于向中枢神经系统(CNS)递送药物、RNA和蛋白质的兴趣。为了克服血脑屏障(BBB),外泌体需要靶向脑内皮的脑归巢肽修饰,但这可能增加免疫应答。在这里,我们第一次证明,不需要这样的修改来也可以使外泌体透过哺乳动物的BBB。原始巨噬细胞(Mφ)外泌体可以一方面利用整合素淋巴细胞功能相关抗原1LFA-1)和细胞间粘附分子1ICAM-1),另一方面通过碳水化合物结合的C型凝集素受体,与包含BBB的脑微血管内皮细胞相互作用。值得注意的是,炎症中的常见ICAM-1上调能够促进BBB细胞对外泌体的摄取。我们在体内进一步证明,在静脉内(IV)给药后,原始巨噬细胞外泌体能够穿过BBB并将大脑衍生的神经营养因子(BDNF)递送到脑中。这种传播在脑炎症的存在下得到增强。这一研究成果对基础科学具有一定意义,同时也为巨噬细胞来源外泌体用于治疗中暑神经疾病治疗提供了一种潜在的载体。
PS:这是一篇介绍外泌体作为药物载体的文章。如何使药物透过血脑屏障进入中枢神经体统从而提高中枢神经系统中的药物浓度往往是摆在药物研发机构面前的主要难题,工程改造过的外泌体也许可以实现透过血脑屏障的目的,但是可能带来一些免疫反应。本文为大家提供了一个相对比较好的解决方案,作者发现巨噬细胞外泌体具有透过血脑屏障的天然性质,这对于基础研究和未来的应用都就是十分重要的意义。
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4.       Exosomes Mediate Epithelium-Mesenchyme Crosstalk inOrgan Development.外泌体介导上皮-间质细胞之间的交互通讯在器官发育过程中发挥重要作用。 [ACS Nano] IF=13.33  PMID28727410
摘要:器官发育需要不同器官的细胞之间的复杂信号传导。上皮和间质相互作用对皮肤,毛囊,肾,肺,前列腺等主要腺体和牙齿的发育至关重要。尽管关于细胞 - 细胞相互作用和配体 - 受体结合有大量的文献报道,细胞外囊泡在器官发生过程中的上皮 - 间质相互作用了解甚少。在这里,我们发现100nm的外泌体由发育中的牙齿器官的上皮和间质分泌,并通过基底膜扩散。外泌体被上皮细胞或间质细胞吞噬,多数是由细胞相互摄取而不是自摄取。外泌体相互诱发细胞分化和基质合成:上皮外胚层诱导间质细胞产生牙本质唾液酸蛋白并进行矿化,而间质外泌体诱导上皮细胞产生基底膜组分,成釉细胞和am原蛋白。通过Rab27a / B敲低或GW4869抑制外泌体分泌能够破坏基底膜,并且在器官培养过程中降低牙釉质和牙本质的产生,在Rab27突变小鼠中能够降低基质合成和减小含有上皮干细胞的颈环的大小。之后,我们分析了外泌体成分,包括miRNA和肽,并进一步与文献中已知的miRNA Wnt调节因子进行联合分析。上皮外泌体衍生的miR135a激活Wnt /β-连环蛋白信号和升级的牙本质基质蛋白的间充质产生。我们的研究结果表明外泌体可能参与器官发育中的上皮 - 间质交互通信,表明这些囊泡和/或其运输的分子内容物可能是治疗疾病或组织再生的介入靶点。
PS:文章介绍了外泌体在牙齿结构发生过程中的重要作用,并利用测序分析发现miR-135a在其中发挥着重要作用。介绍外泌体在上皮-间质细胞交叉通讯中发挥的重要作用。
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5.       Global exosome transcriptome profiling revealsbiomarkers for multiple sclerosis.全身性外泌体转录组显示出多发性硬化相关的生物标志物。 [Ann Neurol] IF=9.64  PMID28411393
摘要:越来越多的证据表明外泌体在免疫调节中具有作用。在本研究中,我们调查了复发-缓解多发性硬化症(RRMS)患者和健康对照组(HC)中的循环外泌体转录组。使用二代测序分析了19RRMS患者(9例复发,10例缓解)和10HC血清外泌体全身性RNA转录谱。我们测得每个样本的500万个reads> 50,000个转录本,同时包括在RRMS中差异表达的微小RNAmiRNA)的详细分析。通过使用数字定量PCR63RRMS患者(33例复发,30例缓解)和32HC的独立样本进行发现集的定量验证。Exosomal RNA 测序检测到15个不同类型的转录本,循环外泌体中4miRNARRMS患者与HC存在差异:hsa-miR-122-5phsa-miR-196b-5phsa-miR- 301a-3phsa-miR-532-5p。在RRMS复发期间,这些miRNA的血清含量水平显着降低。增强型脑磁共振成像患者的这些miRNA也是降低的。中这些miRNARRMS患者外周血单核细胞体外泌体中也明显受损。这些数据表明在RRMS患者循环外泌体中具有不同的RNA成分。因为这些miRNA的预测靶标包括STAT3以及AHR,这些数据表明在这种疾病中细胞与细胞之间的通讯受到干扰。因此,外泌体中miRNA可能是区分多发性硬化症复发的潜在生物标志物。
PS:一篇使用高通量测序寻找多发性硬化相关生物标志物的文章,文章思路简单清晰,目前正在从外泌体中寻找标志物的朋友可以作为一个参考。
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6.       Comparison of Non-Coding RNAs in Exosomes andFunctional Efficacy of Human Embryonic Stem Cell- Versus Induced PluripotentStem Cell-Derived Cardiomyocytes.人胚胎干细胞和诱导多能性干细胞分别诱导产生的心机细胞释放的外泌体所携带的非编码RNA功能效率对比。 [Stem Cells] IF=5.9  PMID28710827
PS:一篇比较有意义的文章。作者以人胚胎干细胞和诱导多能性干细胞分别诱导产生的心肌细胞为原始材料,将不同心肌细胞释放的外泌体中携带的非编码RNA进行了对比,这一研究有利于我们更全面的了解人胚胎干细胞和诱导多能性干细胞的异同点。
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7.       VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-inducedendothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia. VAMP3SNAP23介导扰动流诱导的内皮微小RNA分泌和平滑肌增生。 [Proc Natl Acad Sci U S A] IF=9.42  PMID28716920
PS:一篇介绍小RNA释放分泌机制的文章,介绍了VAMP3SNAP23miR-126-3p分泌中的作用机制。
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本周pubmed收录了J Extracell Vesicles近来几个月发表的10篇文章。该杂志作为囊泡领域的专业期刊,虽然现在还没有影响因子,但阅读该杂志也能发现其收录的论文都很值得我们学习和借鉴,值得我们关注。
A.       Comprehensive toxicity andimmunogenicity studies reveal minimal effects in mice following sustained dosingof extracellular vesicles derived from HEK293T cells.全面评估表明来自HEK293T细胞的细胞外囊泡对小鼠毒性和免疫性影响很小。 [J Extracell Vesicles] IF=  PMID28717420
摘要:细胞外囊泡(EVs)正在作为治疗剂或用于药物递送的载体被研究人员广泛研究和评估。 EV的临床前研究通常使用小鼠或其他动物模型来评估功效和特性。然而,由于评估中的大多数EV来源于人类细胞,它们可能会引发导致毒性或增强EV清除率的免疫反应。此外,来自不同细胞源的EV或包含各种货物的EV在免疫原性或毒性方面的特性也不同。为了评估EV诱导的免疫反应和毒性,我们连续3周使用静脉内和腹膜内给予C57BL / 6小鼠来自从野生型或工程改造的HEK293T细胞释放的EVs(工程改造的HEK293T能够产生装载有miR-199a-3p和嵌合蛋白质的EVs)。收集血液以评估血液学、血液化学和免疫学标记物。对脾细胞进行免疫表型分析,收集组织用于总体尸检和组织病理学检查。最终结果表明没有观察到毒性迹象,并且只有极少量的免疫标记物在工程改造的HEK293T细胞EV处理组具有变化,而野生型HEK293T细胞EV不会有这些变化。
PS:细胞外囊泡用于医学研究是否具有毒性和免疫性,这篇文章对这一问题进行了一定的解答。
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B.       Exosomes purified from a single celltype have diverse morphology.单一细胞类型来源的外泌体也表现出形态学的多样性。[J Extracell Vesicles] IF=  PMID28717422
摘要:细胞外囊泡(EVs)所有已知具有细胞结构的生物体均会产生并且对于细胞通信和生理发挥重要作用的具膜囊泡结构。目前已经有文献描述了关于体液如血浆,母乳和射精中发现的EV的形态多样性。然而,目前依旧没有从单细胞类型纯化外泌体的详细形态学分析报告。在本研究中,我们通过多电子显微镜技术分析和定量了从人类肥大细胞系HMC-1纯化的外泌体的形态。结果显示这些外泌体的形态具有多样性,着表明可能存在具有不同功能的外泌体亚群。我们的研究结果意味着需要一种新的更有效的定义外泌体亚群的方法。我们提出了一个外泌体分类系统,利用这一系统根据外泌体的体型和形状将其分为9个不同的亚型。独立于形态分类系统之外,我们还发现了外泌体具有的三种其他的形态学特点。这些研究结果表明,从单个细胞系纯化的外泌体也具有形态多样性,与以前对体液中EVs的观察结果相似。这些知识可以帮助我们改善对实验结果的理解,扩大我们对外泌体生物学功能的理解。
PS:细胞外囊泡的精细分类一直是摆在众多研究者面前的重要问题,而外泌体是否依据其形态和功能具有更细致的分类是目前人们关注的一个问题,这篇文章对这一问题进行了一定的解答。
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C.       Extracellular vesicles releasedfollowing heat stress induce bystander effect in unstressed populations.。热激处理带来的细胞外囊泡释放能够诱导未受应激群体的旁效应 [J Extracell Vesicles] IF=  PMID28717426
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D.       Low active loading of cargo intoengineered extracellular vesicles results in inefficient miRNA mimic delivery.分子进入细胞外囊泡的低效率会导致miRNA mimic递送效果和功能的降低。 [J Extracell Vesicles] IF=  PMID28717424
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E.       Contribution of neuroblastoma-derivedexosomes to the production of pro-tumorigenic signals by bone marrowmesenchymal stromal cells.神经母细胞瘤来源的外泌体能够影响骨髓中间充质干细胞促肿瘤相关信号的产生。 [J Extracell Vesicles] IF= PMID28717423
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F.       Isolation of membrane vesicles from prokaryotes: atechnical and biological comparison reveals heterogeneity.从原核生物中分离膜泡:技术性和生物学比较揭示其异质性。 [J Extracell Vesicles] IF= PMID28717421
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G.       Platelet extracellular vesicles inducea pro-inflammatory smooth muscle cell phenotype.血小板细胞外囊泡能够诱导平滑肌细胞的促炎表型。 [J Extracell Vesicles] IF= PMID28717419
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H.       A novel community driven software forfunctional enrichment analysis of extracellular vesicles data. 一种用于细胞外囊泡数据功能富集分析的新型社区型驱动软件。[J Extracell Vesicles] IF=  PMID28717418
PS:如题!这个软件很可能你会用到。
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I.        Analysis of extracellular RNA in cerebrospinal fluid.脑脊液中细胞外RNA分析。 [J Extracell Vesicles] IF= PMID28717417
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J.       Feasibility of urinary extracellular vesicle proteomeprofiling using a robust and simple, clinically applicable isolation method. 使用稳定且简单,临床适用的分离方法进行尿细胞外囊泡分离和蛋白质组分析。 [J Extracell Vesicles] IF= PMID28717416
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