外泌体之家 | 细胞外膜泡领域核心平台—exosomes & microvesicles—小膜泡大作用

 找回密码
 立即注册
查看: 151|回复: 6

测序结果核糖体污染!

[复制链接]

1

主题

15

帖子

144

积分

注册会员

Rank: 2

积分
144
发表于 2016-12-30 14:07:04 | 显示全部楼层 |阅读模式
  最近开展外泌体miRNA的研究,提取RNA后检测,结果显示样品核糖体污染,不知大家出现过这种情况吗?是细胞污染的原因吗,要如何避免呢?虚心向大家请教~谢谢!
  我猜想是我没有进行过滤处理,有可能是这个原因吗?
回复

使用道具 举报

0

主题

66

帖子

643

积分

高级会员

Rank: 4

积分
643
发表于 2016-12-31 02:50:39 | 显示全部楼层
hzangs 发表于 2016-12-30 14:57
根据一些做测序朋友的反馈。外泌体测序的时候确实会测到大约20%的数据是核糖体序列、 ...

我们实验室做过蛋白组分析,exosomes携带核糖体
回复 支持 1 反对 0

使用道具 举报

132

主题

890

帖子

3649

积分

超级版主

Rank: 8Rank: 8

积分
3649
发表于 2016-12-30 14:57:32 | 显示全部楼层
根据一些做测序朋友的反馈。外泌体测序的时候确实会测到大约20%的数据是核糖体序列、
回复 支持 反对

使用道具 举报

132

主题

890

帖子

3649

积分

超级版主

Rank: 8Rank: 8

积分
3649
发表于 2016-12-31 11:48:58 | 显示全部楼层
baishixiaoyaozi 发表于 2016-12-31 02:50
我们实验室做过蛋白组分析,exosomes携带核糖体

嗯嗯,  这个确实有paper报道的数据也显示 测序结果中有核糖体序列
回复 支持 反对

使用道具 举报

20

主题

132

帖子

694

积分

高级会员

Rank: 4

积分
694
发表于 2017-1-3 21:34:35 | 显示全部楼层
baishixiaoyaozi 发表于 2016-12-31 02:50
我们实验室做过蛋白组分析,exosomes携带核糖体

您好,请教一下大神怎么在外泌体的蛋白组学分析里面,分析出携带核糖体信息?
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

66

帖子

643

积分

高级会员

Rank: 4

积分
643
发表于 2017-1-3 23:19:34 | 显示全部楼层
微泡biomarker 发表于 2017-1-3 21:34
您好,请教一下大神怎么在外泌体的蛋白组学分析里面,分析出携带核糖体信息? ...

质谱分析检测到多个核糖体亚基蛋白,后续western blot进一步验证
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

13

帖子

118

积分

注册会员

Rank: 2

积分
118
发表于 2017-1-4 11:48:36 | 显示全部楼层
外泌体不是本身就是从核糖体源头分泌而来的吗,肯定是很多成分是核糖体吧
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

关闭

站长推荐上一条 /1 下一条

QQ|Archiver|手机版|外泌体之家 | exosomes & microvesicles ( 沪ICP备14036105号-1

GMT+8, 2017-6-26 06:38 , Processed in 0.170159 second(s), 28 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表