外泌体之家 | 细胞外膜泡领域核心平台—exosomes & microvesicles—小膜泡大作用

 找回密码
 立即注册
查看: 514|回复: 7

大家给公司做miRNA测序会遇到什么常见问题?新手求教

[复制链接]

1

主题

15

帖子

155

积分

注册会员

Rank: 2

积分
155
发表于 2017-9-27 19:36:26 | 显示全部楼层 |阅读模式
最近打算做miRNA测序,找了公司咨询,需要注意哪些细节?比如说:1.测序方法:芯片还是二代测序?
2.测序样品质检和外泌体量
3.后续服务:如果建库失败,损失谁负责
等诸如此类的问题。
想问做过测序的大神,测序有什么坑需要注意,我觉得作为新手的我可能会遇到很多问题,求指教,谢谢!
回复

使用道具 举报

0

主题

130

帖子

1465

积分

金牌会员

Rank: 6Rank: 6

积分
1465
发表于 2017-9-27 21:34:45 | 显示全部楼层
最近也想做extracellular small RNA sequencing
1. 我打算用NGS,好处是unbiased,信息量会比较大,包括miRNA和其他small RNAs,缺点么,费钱;芯片的话,如果只focus miRNA,有很多不同公司的芯片可以选择
2. 样品质检,打算用agilent bioanayzer,业内金标准;exosome/miRNA amount越多越好,至少达到建库的最低标准
3. 所在学校的core facility不提供建库服务,打算自己买kit,自己建库,正在学习中
其实测序只是第一步,后续的分析也很重要。
回复 支持 反对

使用道具 举报

1

主题

15

帖子

155

积分

注册会员

Rank: 2

积分
155
 楼主| 发表于 2017-9-28 09:18:33 | 显示全部楼层
baishixiaoyaozi 发表于 2017-9-27 21:34
最近也想做extracellular small RNA sequencing
1. 我打算用NGS,好处是unbiased,信息量会比较大,包括miR ...

谢谢亲的回复,受教了!
回复 支持 反对

使用道具 举报

1

主题

20

帖子

125

积分

注册会员

Rank: 2

积分
125
发表于 2017-10-9 10:13:15 | 显示全部楼层
哪家公司比较好?最近也打算做这个
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

2

帖子

18

积分

新手上路

Rank: 1

积分
18
发表于 2017-11-14 12:23:25 | 显示全部楼层
1个人认为还是二代测序吧,芯片假阳性会有
2用安捷伦2100质检,如果偏重于mRNA,或者LncRNA的话,润值需要达到8.0
3测序上机浓度要达到200ng/ul,样本量尽量多,做转录组一次不一定能做好,必须重复建库的。起码要准备3次建库的量吧
4对于外泌体RNA,最关键的是外泌体的富集和提取
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

4

帖子

20

积分

新手上路

Rank: 1

积分
20
发表于 2018-1-10 10:46:00 | 显示全部楼层
大有收获
回复

使用道具 举报

0

主题

9

帖子

64

积分

注册会员

Rank: 2

积分
64
发表于 2018-7-16 13:16:09 | 显示全部楼层
biowinner 发表于 2017-11-14 12:23
1个人认为还是二代测序吧,芯片假阳性会有
2用安捷伦2100质检,如果偏重于mRNA,或者LncRNA的话,润值需要 ...

请问,哪家公司比较靠谱一点吖?最近也有打算做
回复 支持 反对

使用道具 举报

0

主题

8

帖子

64

积分

注册会员

Rank: 2

积分
64
发表于 2018-7-18 13:40:19 | 显示全部楼层
笨笨珍 发表于 2018-7-16 13:16
请问,哪家公司比较靠谱一点吖?最近也有打算做

上海英拜生物公司吧,这家公司做的项目挺多的,测序方面的技术比较成熟,这是该公司的网站http://www.yingbio.com/
回复 支持 反对

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

关闭

站长推荐上一条 /1 下一条

QQ|Archiver|手机版|外泌体之家 | exosomes & microvesicles ( 沪ICP备14036105号-1 

GMT+8, 2018-9-21 08:37 , Processed in 0.204112 second(s), 29 queries .

Powered by Discuz! X3.3

© 2001-2017 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表