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Cell同期发表多篇外泌体与细胞外RNA文章

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发表于 2019-4-8 20:27:54 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 Johnny 于 2019-4-8 20:27 编辑

Cell同期发表多篇外泌体与细胞外RNA文章


最新一期的Cell杂志上,同期发表了7篇外泌体与细胞外RNA(exRNA)文章。内容包括外泌体PD-L1、外泌体组成重新评估、exRNA在多种体液/多种细胞外组分中的精细分析等。其中,2篇关于外泌体的Featured Articles,2篇关于exRNA的Resources,perspective、minireview和preview各1篇。

1. Poggio M, Hu T, Pai CC, Chu B, Belair CD, Chang A, Montabana E, Lang UE, Fu Q, Fong L, Blelloch R. Suppression of Exosomal PD-L1 Induces Systemic Anti-tumor Immunity and Memory. Cell. 2019 Apr 4;177(2):414-427.e13. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.016.

该研究发现肿瘤来源的外泌体上的PD-L1参与了肿瘤细胞的免疫治疗逃避。重要的是,对于一些PD-L1抗体治疗效果不佳的肿瘤类型,通过抑制外泌体PD-L1分泌并同时进行PD-L1抗体治疗,能够实现良好的抗肿瘤免疫治疗。
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2. Jeppesen DK, Fenix AM, Franklin JL, Higginbotham JN, Zhang Q, Zimmerman LJ, Liebler DC, Ping J, Liu Q, Evans R, Fissell WH, Patton JG, Rome LH, Burnette DT, Coffey RJ. Reassessment of Exosome Composition. Cell. 2019 Apr 4;177(2):428-445.e18. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.029.
该研究根据严格的分离方法对外泌体组成进行了重新评估,确定了蛋白质、RNA和DNA在小细胞外囊泡和非囊泡细胞外物质之间的差异分布,并确定小细胞外囊泡不是活跃的DNA释放载体,annexin A1是经典质膜形成的微泡的一个标志蛋白。
详细报道见本期头条。
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3. Pluchino S, Smith JA. Explicating Exosomes: Reclassifying the Rising Stars of Intercellular Communication. Cell. 2019 Apr 4;177(2):225-227. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.020.
这是一篇针对Reassessment of Exosome Composition研究文章的preview。
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4. Murillo OD, Thistlethwaite W, Rozowsky J, Subramanian SL, Lucero R, Shah N, Jackson AR, Srinivasan S, Chung A, Laurent CD, Kitchen RR, Galeev T, Warrell J, Diao JA, Welsh JA, Hanspers K, Riutta A, Burgstaller-Muehlbacher S, Shah RV, Yeri A, Jenkins LM, Ahsen ME, Cordon-Cardo C, Dogra N, Gifford SM, Smith JT, Stolovitzky G, Tewari AK, Wunsch BH, Yadav KK, Danielson KM, Filant J, Moeller C, Nejad P, Paul A, Simonson B, Wong DK, Zhang X, Balaj L, Gandhi R, Sood AK, Alexander RP, Wang L, Wu C, Wong DTW, Galas DJ, Van Keuren-Jensen K, Patel T, Jones JC, Das S, Cheung KH, Pico AR, Su AI, Raffai RL, Laurent LC, Roth ME, Gerstein MB, Milosavljevic A. exRNA Atlas Analysis Reveals Distinct Extracellular RNA Cargo Types and Their Carriers Present across Human Biofluids. Cell. 2019 Apr 4;177(2):463-477.e15. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.018.
该报道展示了一份来自五种人类生物体液(血清、血浆、脑脊液、唾液和尿液)的细胞外RNA图谱,显示了六种细胞外RNA载体类型,包括囊泡载体和非囊泡载体。
为了开发细胞外RNA (exRNA)介导的细胞间通讯图谱,NIH细胞外RNA通讯联盟(Extracellular RNA Communication Consortium)创建了exRNA图谱资源(https://exrna-atlas.org)。Atlas版本4P1包含来自19项研究的5309个exRNA-seq和exRNA qPCR概要文件,以及一套分析和可视化工具。通过分析,该研究得到了一个包含六种exRNA类型(CT1、CT2、CT3A、CT3B、CT3C、CT4)的模型,每种exRNA类型都可以在多种生物体液(血清、血浆、脑脊液、唾液、尿液)中检测到。五种exRNA类型与已知的囊泡和非囊泡(脂蛋白和核糖核酸蛋白) exRNA载体有关。
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5. Srinivasan S, Yeri A, Cheah PS, Chung A, Danielson K, De Hoff P, Filant J, Laurent CD, Laurent LD, Magee R, Moeller C, Murthy VL, Nejad P, Paul A, Rigoutsos I, Rodosthenous R, Shah RV, Simonson B, To C1, Wong D, Yan IK, Zhang X, Balaj L, Breakefield XO, Daaboul G, Gandhi R, Lapidus J, Londin E, Patel T, Raffai RL, Sood AK, Alexander RP, Das S, Laurent LC. Small RNA Sequencing across Diverse Biofluids Identifies Optimal Methods for exRNA Isolation. Cell. 2019 Apr 4;177(2):446-462.e16. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.024.
由于缺乏关于细胞外RNA (exRNA)分离方法性能的认识,导致研究的重复性差,阻碍了exRNA领域的进展。通过对5种生物液体中10种exRNA分离方法的系统比较,发现所得到的小RNA-seq图谱的复杂性和重现性存在显著差异。每种方法对不同的exRNA载体亚类的相对效率是通过估计细胞外囊泡(EV)-、核糖核蛋白(RNP)-和高密度脂蛋白(HDL)特异性miRNA在每个图谱中的比例来确定的。开发了一种基于web的交互式应用程序(miRDaR),以帮助研究人员为他们的研究选择最佳的exRNA分离方法。这些结果将提高可重复性,并促进exRNA生物标志物的进一步发展。
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6. Das S; Extracellular RNA Communication Consortium, Ansel KM, Bitzer M, Breakefield XO, Charest A, Galas DJ, Gerstein MB, Gupta M, Milosavljevic A, McManus MT, Patel T, Raffai RL, Rozowsky J, Roth ME, Saugstad JA, Van Keuren-Jensen K, Weaver AM, Laurent LC. The Extracellular RNA Communication Consortium: Establishing Foundational Knowledge and Technologies for Extracellular RNA Research. Cell. 2019 Apr 4;177(2):231-242. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.023. Review.
这是一篇关于exRNA的perspective。细胞外RNA通讯联盟(ERCC)的启动是为了加快细胞外RNA (exRNA)生物学新领域的进展,并确定exRNAs及其载体,包括细胞外小泡(EVs)是否能够介导细胞间通讯并用于临床应用。
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7. Lässer C. Mapping Extracellular RNA Sheds Lights on Distinct Carriers. Cell. 2019 Apr 4;177(2):228-230. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.027.
这是一篇关于exRNA的minireview。
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