Clin Chem | 复旦大学研究团队揭示了人类血浆中细胞外囊泡长链RNA组分特征及其潜在应用
细胞外囊泡(Extracellular vesicles, EVs, 主要包括外泌体和微囊泡) 富含不同类型的RNA，这些RNA具有特定的生物学功能和重要的临床应用价值。然而，目前我们对人血浆中的细胞外囊泡长链RNAs（exLRs）的概况和特征仍然很大程度上未知。近日，来自复旦大学的研究团队在临床化学权威期刊《Clinical Chemistry》发表论文揭示了人血液中丰富的细胞外囊泡长链RNA，并可以作为癌症诊断的潜在生物标志物。 血浆中的细胞外囊泡长链RNA数量众多，但丰度较低，如何有效并稳定的检测是目前主要的瓶颈。该研究提出了血浆细胞外囊泡长链RNA测序（exLR-seq）的优化策略，在来自1-2mL血浆的每个exLR-seq样品中可靠地检测到超过10000个exLRs，包括mRNA，circRNA和lncRNA。 人类血液细胞外囊泡长链RNA测序（exLR-seq） 对血浆exLRs的分析发现，血浆中存在着部分完整性的mRNA，提示可能介导功能。血浆中的细胞外囊泡环状RNA是富集的，数量很多，但样本间差异比较大。血浆exLRs还存在性别和年龄差异的靶点。重要的是，血浆exLRs包括了三分之一的组织特异性RNA，这些exLRs可反映它们的组织来源；而且血浆exLRs还可评估不同免疫细胞组分。 细胞外囊泡长链RNAs（exLRs）可判断性别、年龄和组织来源
此外，研究表明exLRs谱可以有效的区分癌症患者与健康个体，进一步发现了8个exLRs可作为肝细胞癌（HCC）诊断的生物标志物，在训练组、验证组和测试组都具有较高的诊断效能。该研究揭示了人血浆中丰富的细胞外囊泡长链RNAs（exLRs），可作为癌症诊断的潜在生物标志物。由于exLRs数量众多，含有各种组织细胞特异靶点，对各种疾病的诊断、预后和疗效判断等也具有重要意义。目前对exLRs的研究才刚开始，随着exLRs检测方法的不断完善，相信后续会有很多有价值的exLRs靶点被发现，并有望应用于临床。 该文章的第一作者为复旦大学博士研究生李玉琛和硕士研究生赵晶晶，通讯作者为复旦大学附属肿瘤医院/生物医学研究院黄胜林研究员、何祥火研究员和复旦大学附属肿瘤医院王鹏副主任。据悉，研究团队将对之前建立的数据库exoRBase（www.exoRBase.org）进行更新，收录更多的样本和数据，并给出exLRs检测和分析的详细方法；同时将推出人类细胞外囊泡/外泌体RNA图谱计划，旨在建立exLRs检测和分析标准/方案，构建正常人和常见疾病exLRs图谱。
参考文献： Yuchen Li, Jingjing Zhao, Shulin Yu, Zhen Wang, Xigan He, Yonghui Su, Tianan Guo, Haoyue Sheng, Jie Chen, Qiupeng Zheng, Yan Li, Weijie Guo, Xiaohong Cai, Guohai Shi, Jiong Wu, Lu Wang, Peng Wang, Xianghuo He, Shenglin Huang. (2019) Extracellular vesicles long RNA sequencing reveals abundant mRNA, circRNA and lncRNA in human blood as biomarkers for cancer diagnosis. Clin Chem. 2019 Mar 26. pii: clinchem.2018.301291. 附件已隐藏，回复该贴可查看附件 附件已隐藏，回复该贴可查看附件
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|Archiver|手机版|外泌体之家 | exosomes & microvesicles
发表于 2019-4-3 09:49:21
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