图：Experimental-workflow
结肠直肠癌（colorectal cancer, CRC）的肿瘤细胞会将外泌体释放到体循环中。这些外泌体可以介导细胞之间的通信并影响其靶细胞中的各种肿瘤相关的生物过程。11月3日，来自中国医学科学院的研究人员在肿瘤学期刊International Journal of Cancer上发表了题为“Protein content and functional characteristics of serum-purified exosomes from patients with colorectal cancer revealed by quantitative proteomics”的文章，他们对从CRC患者和正常志愿者的血清中纯化的外泌体进行定量蛋白质组学分析。数据是通过识别码PXD003875的ProteomeXchange获得的。研究人员在Exocarta蛋白质列表中鉴定了918个蛋白质，涵盖了725个基因ID。
与正常志愿者的血清纯化外泌体（serum-purified exosomes，SPE）相比，他们发现在CRC患者的SPE中的36个蛋白表达上调和22个蛋白表达下调。生物信息学分析表明上调的蛋白质参与调节肿瘤微环境转移前的过程。相比之下，在肿瘤生长和细胞存活中起关键作用的差异表达蛋白（differentially expressed proteins，DEP）多数被下调。
下图：蛋白质通路分析（整合素介导的细胞粘附途径）
所有验证的蛋白质按照wiki的通路数据库作图。蛋白质由标记有蛋白质名称的框表示。CRC患者的SPE中的相对蛋白表达水平由不同的颜色指示。在本研究中未鉴定出的蛋白标注灰色。
这项研究表明，CRC患者的SPEs在促进肿瘤侵袭性中起关键作用，但对假设的肿瘤存活或增殖的改变的影响不大。 根据生物信息学分析，研究人员推测，外泌体的蛋白质含量可能与其是否参与转移前的生长位置的建立或转移性肿瘤细胞的生长和存活相关。该研究将有助于阐明肿瘤来源的外泌体的病理生理功能，并有助于对CRC诊断和治疗的发展。
参考文献：Chen Y, Xie Y, Xu L, Zhan S, Xiao Y, Gao Y, Wu B, Ge W. (2016) Protein content and functional characteristics of serum-purified exosomes from patients with colorectal cancer revealed by quantitative proteomics. Int J Cancer [Epub ahead of print].
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|Archiver|手机版|外泌体之家 | exosomes & microvesicles
发表于 2016-11-10 21:53:50
收藏
楼主
发表于 2016-11-21 11:44:32
thank you 