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【投稿经验】审稿人对SBI试剂盒的疑问及解决

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发表于 2016-7-4 09:34:01 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 惜名 于 2016-7-4 09:35 编辑

本人正在投一篇Scientific Reports(水刊,求大神不要嘲笑)
用SBI试剂盒提取的exo,审稿人针对这个方法提出了如下comments,分享给各位群里的战友:

In Fig. 1, western blot analysis was performed using cell lysates and exosome lysates as starting materials. However, purified exosomes, especially if a polymer-based extraction kit such as the Exo-Quick kit is used, are heavily contaminated with carry-over proteins and cell debris from the initial DC culture media. Therefore, the authors should add a control were the same exosome samples are first digested with proteinase K to eliminate extra-exosomal contaminants and then lysed and used for western blot analysis. This control would help determine whether the indicated markers are of exosomal origin or not.  




补实验中。。。都毕业了还要给自己擦屁股,唉。。。
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发表于 2017-10-19 23:38:19 | 只看该作者
惜名 发表于 2016-10-21 17:18
这个我也不知道,哈哈

100 μg/ml of proteinase K at 37°C for 30 min to remove surface proteins
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4895447/
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发表于 2016-7-4 09:57:55 | 只看该作者
值得借鉴的意见。
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发表于 2016-7-4 10:01:08 | 只看该作者
想问一下这里面用的proteinase K 会不会也降解了exosome 膜上的蛋白呢,还有这个降解时间怎么控制呢。
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 楼主| 发表于 2016-7-4 10:03:12 | 只看该作者
hzangs 发表于 2016-7-4 09:57
值得借鉴的意见。

审稿人没直接要求用超离重新做,我已经谢天谢地了,哈哈
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 楼主| 发表于 2016-7-4 10:03:52 | 只看该作者
微泡biomarker 发表于 2016-7-4 10:01
想问一下这里面用的proteinase K 会不会也降解了exosome 膜上的蛋白呢,还有这个降解时间怎么控制呢。 ...

我也不知道咋控制时间,打算查查资料先试试。。。
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发表于 2016-7-4 10:36:27 | 只看该作者
惜名 发表于 2016-7-4 10:03
审稿人没直接要求用超离重新做,我已经谢天谢地了,哈哈

proteinase K 这样处理 有人做过?
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 楼主| 发表于 2016-7-4 10:43:53 | 只看该作者
hzangs 发表于 2016-7-4 10:36
proteinase K 这样处理 有人做过?

这个方法我在文献里也没看到过。
但考虑到我现在是补实验,肯定要尊重审稿人的意见了,打算先这样做起来。
这个审稿人既然提出了这个建议,或许也是外泌体的“业内人士”。。。
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发表于 2016-7-4 11:00:38 | 只看该作者
对啊,起码没有全盘否定试剂盒的提取效果。
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发表于 2016-7-4 11:05:26 | 只看该作者
惜名 发表于 2016-7-4 10:43
这个方法我在文献里也没看到过。
但考虑到我现在是补实验,肯定要尊重审稿人的意见了,打算先这样做起来 ...

嗯  同行评议嘛     反正目的是投出去    投reviewer的所好吧~
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 楼主| 发表于 2016-7-5 09:02:45 | 只看该作者
Johnny 发表于 2016-7-4 18:19
惜名兄棒棒哒 O(∩_∩)O~

水刊,以后都不好意思讲。。。
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